Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT6

NLRX1, NLR family member X1, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRX1Q86UT6 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NLRX1Q86UT6 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NLRX1Q86UT6 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NLRX1Q86UT6 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NLRX1Q86UT6 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NLRX1Q86UT6 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NLRX1Q86UT6 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NLRX1Q86UT6 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NLRX1Q86UT6 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NLRX1Q86UT6 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NLRX1Q86UT6 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NLRX1Q86UT6 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NLRX1Q86UT6 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NLRX1Q86UT6 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NLRX1Q86UT6 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NLRX1Q86UT6 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
NLRX1Q86UT6 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
NLRX1Q86UT6 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NLRX1Q86UT6 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NLRX1Q86UT6 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NLRX1Q86UT6 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
NLRX1Q86UT6 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NLRX1Q86UT6 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NLRX1Q86UT6 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NLRX1Q86UT6 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NLRX1Q86UT6 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NLRX1Q86UT6 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
NLRX1Q86UT6 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NLRX1Q86UT6 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NLRX1Q86UT6 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
NLRX1Q86UT6 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
NLRX1Q86UT6 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NLRX1Q86UT6 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NLRX1Q86UT6 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NLRX1Q86UT6 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
NLRX1Q86UT6 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NLRX1Q86UT6 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NLRX1Q86UT6 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NLRX1Q86UT6 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
NLRX1Q86UT6 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NLRX1Q86UT6 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NLRX1Q86UT6 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NLRX1Q86UT6 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NLRX1Q86UT6 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NLRX1Q86UT6 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NLRX1Q86UT6 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NLRX1Q86UT6 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NLRX1Q86UT6 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NLRX1Q86UT6 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NLRX1Q86UT6 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NLRX1Q86UT6 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NLRX1Q86UT6 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NLRX1Q86UT6 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NLRX1Q86UT6 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NLRX1Q86UT6 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NLRX1Q86UT6 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NLRX1Q86UT6 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NLRX1Q86UT6 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NLRX1Q86UT6 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NLRX1Q86UT6 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NLRX1Q86UT6 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NLRX1Q86UT6 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NLRX1Q86UT6 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NLRX1Q86UT6 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NLRX1Q86UT6 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NLRX1Q86UT6 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NLRX1Q86UT6 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NLRX1Q86UT6 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NLRX1Q86UT6 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NLRX1Q86UT6 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NLRX1Q86UT6 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NLRX1Q86UT6 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
NLRX1Q86UT6 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NLRX1Q86UT6 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NLRX1Q86UT6 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NLRX1Q86UT6 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NLRX1Q86UT6 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NLRX1Q86UT6 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NLRX1Q86UT6 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NLRX1Q86UT6 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NLRX1Q86UT6 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NLRX1Q86UT6 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NLRX1Q86UT6 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NLRX1Q86UT6 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NLRX1Q86UT6 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NLRX1Q86UT6 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NLRX1Q86UT6 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NLRX1Q86UT6 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NLRX1Q86UT6 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NLRX1Q86UT6 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NLRX1Q86UT6 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NLRX1Q86UT6 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
NLRX1Q86UT6 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NLRX1Q86UT6 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NLRX1Q86UT6 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
NLRX1Q86UT6 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NLRX1Q86UT6 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NLRX1Q86UT6 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NLRX1Q86UT6 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
NLRX1Q86UT6 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms