Protein–RNA interactions for Protein: Q86TU7

SETD3, Histone-lysine N-methyltransferase setd3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD3Q86TU7 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SETD3Q86TU7 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SETD3Q86TU7 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SETD3Q86TU7 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SETD3Q86TU7 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SETD3Q86TU7 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SETD3Q86TU7 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SETD3Q86TU7 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SETD3Q86TU7 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SETD3Q86TU7 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SETD3Q86TU7 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SETD3Q86TU7 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SETD3Q86TU7 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SETD3Q86TU7 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SETD3Q86TU7 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SETD3Q86TU7 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SETD3Q86TU7 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SETD3Q86TU7 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SETD3Q86TU7 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SETD3Q86TU7 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SETD3Q86TU7 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SETD3Q86TU7 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SETD3Q86TU7 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SETD3Q86TU7 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SETD3Q86TU7 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SETD3Q86TU7 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SETD3Q86TU7 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SETD3Q86TU7 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SETD3Q86TU7 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SETD3Q86TU7 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SETD3Q86TU7 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SETD3Q86TU7 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SETD3Q86TU7 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SETD3Q86TU7 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SETD3Q86TU7 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SETD3Q86TU7 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SETD3Q86TU7 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SETD3Q86TU7 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SETD3Q86TU7 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SETD3Q86TU7 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SETD3Q86TU7 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SETD3Q86TU7 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SETD3Q86TU7 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SETD3Q86TU7 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SETD3Q86TU7 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SETD3Q86TU7 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SETD3Q86TU7 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SETD3Q86TU7 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SETD3Q86TU7 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SETD3Q86TU7 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SETD3Q86TU7 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SETD3Q86TU7 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SETD3Q86TU7 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SETD3Q86TU7 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SETD3Q86TU7 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SETD3Q86TU7 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SETD3Q86TU7 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SETD3Q86TU7 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SETD3Q86TU7 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SETD3Q86TU7 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SETD3Q86TU7 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
SETD3Q86TU7 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SETD3Q86TU7 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SETD3Q86TU7 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SETD3Q86TU7 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SETD3Q86TU7 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SETD3Q86TU7 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SETD3Q86TU7 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SETD3Q86TU7 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SETD3Q86TU7 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SETD3Q86TU7 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SETD3Q86TU7 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SETD3Q86TU7 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SETD3Q86TU7 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SETD3Q86TU7 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SETD3Q86TU7 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SETD3Q86TU7 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SETD3Q86TU7 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SETD3Q86TU7 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SETD3Q86TU7 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SETD3Q86TU7 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SETD3Q86TU7 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SETD3Q86TU7 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SETD3Q86TU7 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SETD3Q86TU7 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SETD3Q86TU7 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SETD3Q86TU7 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SETD3Q86TU7 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SETD3Q86TU7 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SETD3Q86TU7 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SETD3Q86TU7 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SETD3Q86TU7 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SETD3Q86TU7 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SETD3Q86TU7 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SETD3Q86TU7 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SETD3Q86TU7 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SETD3Q86TU7 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SETD3Q86TU7 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SETD3Q86TU7 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SETD3Q86TU7 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms