Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3C6

ATG9A, Autophagy-related protein 9A, humanhuman

Predictions only

Length 839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG9AQ7Z3C6 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ATG9AQ7Z3C6 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ATG9AQ7Z3C6 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
ATG9AQ7Z3C6 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ATG9AQ7Z3C6 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ATG9AQ7Z3C6 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ATG9AQ7Z3C6 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
ATG9AQ7Z3C6 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ATG9AQ7Z3C6 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ATG9AQ7Z3C6 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ATG9AQ7Z3C6 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ATG9AQ7Z3C6 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ATG9AQ7Z3C6 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ATG9AQ7Z3C6 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ATG9AQ7Z3C6 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ATG9AQ7Z3C6 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ATG9AQ7Z3C6 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ATG9AQ7Z3C6 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ATG9AQ7Z3C6 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ATG9AQ7Z3C6 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
ATG9AQ7Z3C6 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ATG9AQ7Z3C6 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ATG9AQ7Z3C6 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
ATG9AQ7Z3C6 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ATG9AQ7Z3C6 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ATG9AQ7Z3C6 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ATG9AQ7Z3C6 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ATG9AQ7Z3C6 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ATG9AQ7Z3C6 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ATG9AQ7Z3C6 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ATG9AQ7Z3C6 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ATG9AQ7Z3C6 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ATG9AQ7Z3C6 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ATG9AQ7Z3C6 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ATG9AQ7Z3C6 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ATG9AQ7Z3C6 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ATG9AQ7Z3C6 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ATG9AQ7Z3C6 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ATG9AQ7Z3C6 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ATG9AQ7Z3C6 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ATG9AQ7Z3C6 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ATG9AQ7Z3C6 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ATG9AQ7Z3C6 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ATG9AQ7Z3C6 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ATG9AQ7Z3C6 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ATG9AQ7Z3C6 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ATG9AQ7Z3C6 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ATG9AQ7Z3C6 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ATG9AQ7Z3C6 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ATG9AQ7Z3C6 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ATG9AQ7Z3C6 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ATG9AQ7Z3C6 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ATG9AQ7Z3C6 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ATG9AQ7Z3C6 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ATG9AQ7Z3C6 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ATG9AQ7Z3C6 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ATG9AQ7Z3C6 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
ATG9AQ7Z3C6 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ATG9AQ7Z3C6 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ATG9AQ7Z3C6 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ATG9AQ7Z3C6 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ATG9AQ7Z3C6 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ATG9AQ7Z3C6 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ATG9AQ7Z3C6 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
ATG9AQ7Z3C6 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
ATG9AQ7Z3C6 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
ATG9AQ7Z3C6 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ATG9AQ7Z3C6 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ATG9AQ7Z3C6 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ATG9AQ7Z3C6 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ATG9AQ7Z3C6 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ATG9AQ7Z3C6 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ATG9AQ7Z3C6 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ATG9AQ7Z3C6 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ATG9AQ7Z3C6 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ATG9AQ7Z3C6 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ATG9AQ7Z3C6 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ATG9AQ7Z3C6 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ATG9AQ7Z3C6 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ATG9AQ7Z3C6 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ATG9AQ7Z3C6 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ATG9AQ7Z3C6 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ATG9AQ7Z3C6 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ATG9AQ7Z3C6 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ATG9AQ7Z3C6 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ATG9AQ7Z3C6 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ATG9AQ7Z3C6 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
ATG9AQ7Z3C6 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
ATG9AQ7Z3C6 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ATG9AQ7Z3C6 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ATG9AQ7Z3C6 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ATG9AQ7Z3C6 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ATG9AQ7Z3C6 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ATG9AQ7Z3C6 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ATG9AQ7Z3C6 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ATG9AQ7Z3C6 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ATG9AQ7Z3C6 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ATG9AQ7Z3C6 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ATG9AQ7Z3C6 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ATG9AQ7Z3C6 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms