Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTM1

OTOP1, Otopetrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP1Q7RTM1 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
OTOP1Q7RTM1 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
OTOP1Q7RTM1 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
OTOP1Q7RTM1 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
OTOP1Q7RTM1 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
OTOP1Q7RTM1 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
OTOP1Q7RTM1 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
OTOP1Q7RTM1 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
OTOP1Q7RTM1 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
OTOP1Q7RTM1 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
OTOP1Q7RTM1 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
OTOP1Q7RTM1 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
OTOP1Q7RTM1 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
OTOP1Q7RTM1 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
OTOP1Q7RTM1 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
OTOP1Q7RTM1 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
OTOP1Q7RTM1 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
OTOP1Q7RTM1 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
OTOP1Q7RTM1 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
OTOP1Q7RTM1 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
OTOP1Q7RTM1 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
OTOP1Q7RTM1 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
OTOP1Q7RTM1 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
OTOP1Q7RTM1 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
OTOP1Q7RTM1 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
OTOP1Q7RTM1 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
OTOP1Q7RTM1 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
OTOP1Q7RTM1 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
OTOP1Q7RTM1 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
OTOP1Q7RTM1 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
OTOP1Q7RTM1 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
OTOP1Q7RTM1 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
OTOP1Q7RTM1 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
OTOP1Q7RTM1 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
OTOP1Q7RTM1 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
OTOP1Q7RTM1 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
OTOP1Q7RTM1 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
OTOP1Q7RTM1 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
OTOP1Q7RTM1 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
OTOP1Q7RTM1 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
OTOP1Q7RTM1 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
OTOP1Q7RTM1 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
OTOP1Q7RTM1 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
OTOP1Q7RTM1 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
OTOP1Q7RTM1 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
OTOP1Q7RTM1 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
OTOP1Q7RTM1 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
OTOP1Q7RTM1 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
OTOP1Q7RTM1 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC26.65■■□□□ 1.86
OTOP1Q7RTM1 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
OTOP1Q7RTM1 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
OTOP1Q7RTM1 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
OTOP1Q7RTM1 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
OTOP1Q7RTM1 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
OTOP1Q7RTM1 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC26.64■■□□□ 1.86
OTOP1Q7RTM1 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
OTOP1Q7RTM1 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
OTOP1Q7RTM1 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
OTOP1Q7RTM1 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
OTOP1Q7RTM1 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
OTOP1Q7RTM1 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
OTOP1Q7RTM1 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
OTOP1Q7RTM1 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
OTOP1Q7RTM1 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
OTOP1Q7RTM1 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
OTOP1Q7RTM1 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
OTOP1Q7RTM1 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
OTOP1Q7RTM1 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
OTOP1Q7RTM1 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
OTOP1Q7RTM1 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
OTOP1Q7RTM1 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
OTOP1Q7RTM1 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
OTOP1Q7RTM1 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
OTOP1Q7RTM1 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
OTOP1Q7RTM1 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
OTOP1Q7RTM1 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
OTOP1Q7RTM1 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
OTOP1Q7RTM1 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
OTOP1Q7RTM1 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
OTOP1Q7RTM1 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
OTOP1Q7RTM1 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC26.61■■□□□ 1.85
OTOP1Q7RTM1 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
OTOP1Q7RTM1 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
OTOP1Q7RTM1 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
OTOP1Q7RTM1 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
OTOP1Q7RTM1 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
OTOP1Q7RTM1 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
OTOP1Q7RTM1 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
OTOP1Q7RTM1 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
OTOP1Q7RTM1 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
OTOP1Q7RTM1 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
OTOP1Q7RTM1 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
OTOP1Q7RTM1 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
OTOP1Q7RTM1 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
OTOP1Q7RTM1 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
OTOP1Q7RTM1 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
OTOP1Q7RTM1 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
OTOP1Q7RTM1 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
OTOP1Q7RTM1 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
OTOP1Q7RTM1 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms