Protein–RNA interactions for Protein: Q76G19

PDZD4, PDZ domain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZD4Q76G19 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDZD4Q76G19 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDZD4Q76G19 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDZD4Q76G19 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PDZD4Q76G19 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDZD4Q76G19 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDZD4Q76G19 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDZD4Q76G19 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDZD4Q76G19 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDZD4Q76G19 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDZD4Q76G19 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDZD4Q76G19 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDZD4Q76G19 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDZD4Q76G19 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDZD4Q76G19 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDZD4Q76G19 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDZD4Q76G19 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDZD4Q76G19 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDZD4Q76G19 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDZD4Q76G19 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDZD4Q76G19 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDZD4Q76G19 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PDZD4Q76G19 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDZD4Q76G19 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDZD4Q76G19 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDZD4Q76G19 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PDZD4Q76G19 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PDZD4Q76G19 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDZD4Q76G19 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDZD4Q76G19 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDZD4Q76G19 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDZD4Q76G19 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDZD4Q76G19 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDZD4Q76G19 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDZD4Q76G19 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDZD4Q76G19 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDZD4Q76G19 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDZD4Q76G19 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDZD4Q76G19 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDZD4Q76G19 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDZD4Q76G19 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDZD4Q76G19 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PDZD4Q76G19 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDZD4Q76G19 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDZD4Q76G19 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDZD4Q76G19 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDZD4Q76G19 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDZD4Q76G19 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDZD4Q76G19 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDZD4Q76G19 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDZD4Q76G19 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PDZD4Q76G19 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDZD4Q76G19 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDZD4Q76G19 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDZD4Q76G19 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDZD4Q76G19 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PDZD4Q76G19 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDZD4Q76G19 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDZD4Q76G19 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PDZD4Q76G19 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PDZD4Q76G19 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDZD4Q76G19 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDZD4Q76G19 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDZD4Q76G19 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PDZD4Q76G19 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDZD4Q76G19 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDZD4Q76G19 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDZD4Q76G19 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDZD4Q76G19 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDZD4Q76G19 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDZD4Q76G19 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDZD4Q76G19 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDZD4Q76G19 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDZD4Q76G19 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDZD4Q76G19 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDZD4Q76G19 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDZD4Q76G19 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PDZD4Q76G19 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDZD4Q76G19 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDZD4Q76G19 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDZD4Q76G19 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDZD4Q76G19 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDZD4Q76G19 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDZD4Q76G19 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDZD4Q76G19 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDZD4Q76G19 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDZD4Q76G19 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDZD4Q76G19 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDZD4Q76G19 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDZD4Q76G19 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDZD4Q76G19 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDZD4Q76G19 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDZD4Q76G19 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDZD4Q76G19 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PDZD4Q76G19 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDZD4Q76G19 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDZD4Q76G19 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDZD4Q76G19 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDZD4Q76G19 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDZD4Q76G19 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms