Protein–RNA interactions for Protein: Q71UM5

RPS27L, 40S ribosomal protein S27-like, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 84 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS27LQ71UM5 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPS27LQ71UM5 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPS27LQ71UM5 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPS27LQ71UM5 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPS27LQ71UM5 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPS27LQ71UM5 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPS27LQ71UM5 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPS27LQ71UM5 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPS27LQ71UM5 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPS27LQ71UM5 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPS27LQ71UM5 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPS27LQ71UM5 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPS27LQ71UM5 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPS27LQ71UM5 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPS27LQ71UM5 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPS27LQ71UM5 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPS27LQ71UM5 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPS27LQ71UM5 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPS27LQ71UM5 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPS27LQ71UM5 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPS27LQ71UM5 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPS27LQ71UM5 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPS27LQ71UM5 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPS27LQ71UM5 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPS27LQ71UM5 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPS27LQ71UM5 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPS27LQ71UM5 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPS27LQ71UM5 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPS27LQ71UM5 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPS27LQ71UM5 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPS27LQ71UM5 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPS27LQ71UM5 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RPS27LQ71UM5 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPS27LQ71UM5 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPS27LQ71UM5 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPS27LQ71UM5 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPS27LQ71UM5 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPS27LQ71UM5 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPS27LQ71UM5 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPS27LQ71UM5 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPS27LQ71UM5 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPS27LQ71UM5 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RPS27LQ71UM5 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPS27LQ71UM5 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RPS27LQ71UM5 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPS27LQ71UM5 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPS27LQ71UM5 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPS27LQ71UM5 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPS27LQ71UM5 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPS27LQ71UM5 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPS27LQ71UM5 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPS27LQ71UM5 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPS27LQ71UM5 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPS27LQ71UM5 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPS27LQ71UM5 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPS27LQ71UM5 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPS27LQ71UM5 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPS27LQ71UM5 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPS27LQ71UM5 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPS27LQ71UM5 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPS27LQ71UM5 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPS27LQ71UM5 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPS27LQ71UM5 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPS27LQ71UM5 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPS27LQ71UM5 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPS27LQ71UM5 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RPS27LQ71UM5 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPS27LQ71UM5 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPS27LQ71UM5 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPS27LQ71UM5 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPS27LQ71UM5 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPS27LQ71UM5 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPS27LQ71UM5 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPS27LQ71UM5 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPS27LQ71UM5 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RPS27LQ71UM5 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPS27LQ71UM5 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPS27LQ71UM5 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPS27LQ71UM5 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPS27LQ71UM5 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPS27LQ71UM5 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RPS27LQ71UM5 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPS27LQ71UM5 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPS27LQ71UM5 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPS27LQ71UM5 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPS27LQ71UM5 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPS27LQ71UM5 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPS27LQ71UM5 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPS27LQ71UM5 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPS27LQ71UM5 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPS27LQ71UM5 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPS27LQ71UM5 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPS27LQ71UM5 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPS27LQ71UM5 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPS27LQ71UM5 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPS27LQ71UM5 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPS27LQ71UM5 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RPS27LQ71UM5 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPS27LQ71UM5 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPS27LQ71UM5 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms