Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZTI6

RFLNA, Refilin-A, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFLNAQ6ZTI6 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RFLNAQ6ZTI6 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RFLNAQ6ZTI6 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RFLNAQ6ZTI6 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RFLNAQ6ZTI6 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RFLNAQ6ZTI6 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RFLNAQ6ZTI6 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RFLNAQ6ZTI6 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RFLNAQ6ZTI6 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RFLNAQ6ZTI6 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RFLNAQ6ZTI6 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RFLNAQ6ZTI6 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RFLNAQ6ZTI6 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
RFLNAQ6ZTI6 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RFLNAQ6ZTI6 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
RFLNAQ6ZTI6 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RFLNAQ6ZTI6 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RFLNAQ6ZTI6 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RFLNAQ6ZTI6 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RFLNAQ6ZTI6 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RFLNAQ6ZTI6 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
RFLNAQ6ZTI6 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RFLNAQ6ZTI6 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RFLNAQ6ZTI6 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RFLNAQ6ZTI6 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RFLNAQ6ZTI6 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RFLNAQ6ZTI6 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RFLNAQ6ZTI6 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RFLNAQ6ZTI6 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RFLNAQ6ZTI6 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RFLNAQ6ZTI6 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RFLNAQ6ZTI6 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RFLNAQ6ZTI6 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RFLNAQ6ZTI6 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RFLNAQ6ZTI6 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RFLNAQ6ZTI6 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RFLNAQ6ZTI6 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RFLNAQ6ZTI6 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RFLNAQ6ZTI6 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RFLNAQ6ZTI6 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RFLNAQ6ZTI6 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RFLNAQ6ZTI6 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RFLNAQ6ZTI6 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RFLNAQ6ZTI6 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RFLNAQ6ZTI6 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RFLNAQ6ZTI6 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RFLNAQ6ZTI6 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RFLNAQ6ZTI6 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RFLNAQ6ZTI6 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RFLNAQ6ZTI6 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RFLNAQ6ZTI6 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RFLNAQ6ZTI6 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RFLNAQ6ZTI6 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RFLNAQ6ZTI6 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RFLNAQ6ZTI6 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RFLNAQ6ZTI6 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RFLNAQ6ZTI6 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RFLNAQ6ZTI6 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RFLNAQ6ZTI6 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RFLNAQ6ZTI6 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RFLNAQ6ZTI6 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RFLNAQ6ZTI6 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RFLNAQ6ZTI6 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFLNAQ6ZTI6 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFLNAQ6ZTI6 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFLNAQ6ZTI6 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFLNAQ6ZTI6 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFLNAQ6ZTI6 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFLNAQ6ZTI6 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFLNAQ6ZTI6 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFLNAQ6ZTI6 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFLNAQ6ZTI6 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFLNAQ6ZTI6 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RFLNAQ6ZTI6 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RFLNAQ6ZTI6 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RFLNAQ6ZTI6 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RFLNAQ6ZTI6 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RFLNAQ6ZTI6 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RFLNAQ6ZTI6 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RFLNAQ6ZTI6 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RFLNAQ6ZTI6 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RFLNAQ6ZTI6 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RFLNAQ6ZTI6 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RFLNAQ6ZTI6 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RFLNAQ6ZTI6 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RFLNAQ6ZTI6 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RFLNAQ6ZTI6 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RFLNAQ6ZTI6 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RFLNAQ6ZTI6 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
RFLNAQ6ZTI6 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RFLNAQ6ZTI6 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RFLNAQ6ZTI6 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RFLNAQ6ZTI6 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RFLNAQ6ZTI6 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RFLNAQ6ZTI6 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RFLNAQ6ZTI6 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RFLNAQ6ZTI6 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RFLNAQ6ZTI6 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RFLNAQ6ZTI6 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RFLNAQ6ZTI6 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 986.1 ms