Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSS7

MFSD6, Major facilitator superfamily domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 791 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFSD6Q6ZSS7 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
MFSD6Q6ZSS7 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MFSD6Q6ZSS7 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MFSD6Q6ZSS7 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MFSD6Q6ZSS7 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
MFSD6Q6ZSS7 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
MFSD6Q6ZSS7 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
MFSD6Q6ZSS7 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
MFSD6Q6ZSS7 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MFSD6Q6ZSS7 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MFSD6Q6ZSS7 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MFSD6Q6ZSS7 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MFSD6Q6ZSS7 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MFSD6Q6ZSS7 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MFSD6Q6ZSS7 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MFSD6Q6ZSS7 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MFSD6Q6ZSS7 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MFSD6Q6ZSS7 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MFSD6Q6ZSS7 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
MFSD6Q6ZSS7 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
MFSD6Q6ZSS7 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MFSD6Q6ZSS7 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MFSD6Q6ZSS7 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
MFSD6Q6ZSS7 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
MFSD6Q6ZSS7 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
MFSD6Q6ZSS7 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
MFSD6Q6ZSS7 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MFSD6Q6ZSS7 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MFSD6Q6ZSS7 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
MFSD6Q6ZSS7 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
MFSD6Q6ZSS7 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MFSD6Q6ZSS7 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MFSD6Q6ZSS7 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MFSD6Q6ZSS7 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MFSD6Q6ZSS7 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MFSD6Q6ZSS7 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MFSD6Q6ZSS7 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MFSD6Q6ZSS7 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MFSD6Q6ZSS7 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MFSD6Q6ZSS7 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MFSD6Q6ZSS7 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MFSD6Q6ZSS7 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MFSD6Q6ZSS7 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MFSD6Q6ZSS7 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
MFSD6Q6ZSS7 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MFSD6Q6ZSS7 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MFSD6Q6ZSS7 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MFSD6Q6ZSS7 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MFSD6Q6ZSS7 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MFSD6Q6ZSS7 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MFSD6Q6ZSS7 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MFSD6Q6ZSS7 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MFSD6Q6ZSS7 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MFSD6Q6ZSS7 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MFSD6Q6ZSS7 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MFSD6Q6ZSS7 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MFSD6Q6ZSS7 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MFSD6Q6ZSS7 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MFSD6Q6ZSS7 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MFSD6Q6ZSS7 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MFSD6Q6ZSS7 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MFSD6Q6ZSS7 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MFSD6Q6ZSS7 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MFSD6Q6ZSS7 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
MFSD6Q6ZSS7 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MFSD6Q6ZSS7 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MFSD6Q6ZSS7 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MFSD6Q6ZSS7 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MFSD6Q6ZSS7 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MFSD6Q6ZSS7 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MFSD6Q6ZSS7 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
MFSD6Q6ZSS7 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
MFSD6Q6ZSS7 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MFSD6Q6ZSS7 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MFSD6Q6ZSS7 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MFSD6Q6ZSS7 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MFSD6Q6ZSS7 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
MFSD6Q6ZSS7 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MFSD6Q6ZSS7 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
MFSD6Q6ZSS7 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
MFSD6Q6ZSS7 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MFSD6Q6ZSS7 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
MFSD6Q6ZSS7 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
MFSD6Q6ZSS7 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MFSD6Q6ZSS7 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
MFSD6Q6ZSS7 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MFSD6Q6ZSS7 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
MFSD6Q6ZSS7 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MFSD6Q6ZSS7 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
MFSD6Q6ZSS7 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MFSD6Q6ZSS7 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
MFSD6Q6ZSS7 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MFSD6Q6ZSS7 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
MFSD6Q6ZSS7 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
MFSD6Q6ZSS7 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MFSD6Q6ZSS7 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
MFSD6Q6ZSS7 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
MFSD6Q6ZSS7 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MFSD6Q6ZSS7 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MFSD6Q6ZSS7 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms