Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRS4

CCDC129, Coiled-coil domain-containing protein 129, humanhuman

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC129Q6ZRS4 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC129Q6ZRS4 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC129Q6ZRS4 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC129Q6ZRS4 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC129Q6ZRS4 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC129Q6ZRS4 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC129Q6ZRS4 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC129Q6ZRS4 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC129Q6ZRS4 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC129Q6ZRS4 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC129Q6ZRS4 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC129Q6ZRS4 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC129Q6ZRS4 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC129Q6ZRS4 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC129Q6ZRS4 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC129Q6ZRS4 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC129Q6ZRS4 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC129Q6ZRS4 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC129Q6ZRS4 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC129Q6ZRS4 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC129Q6ZRS4 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC129Q6ZRS4 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
CCDC129Q6ZRS4 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
CCDC129Q6ZRS4 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC129Q6ZRS4 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC129Q6ZRS4 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC129Q6ZRS4 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC129Q6ZRS4 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC129Q6ZRS4 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC129Q6ZRS4 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC129Q6ZRS4 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC129Q6ZRS4 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC129Q6ZRS4 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC129Q6ZRS4 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC129Q6ZRS4 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC129Q6ZRS4 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC129Q6ZRS4 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC129Q6ZRS4 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC129Q6ZRS4 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC129Q6ZRS4 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC129Q6ZRS4 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC129Q6ZRS4 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC129Q6ZRS4 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC129Q6ZRS4 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC129Q6ZRS4 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC129Q6ZRS4 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC129Q6ZRS4 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC129Q6ZRS4 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC129Q6ZRS4 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC129Q6ZRS4 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC129Q6ZRS4 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC129Q6ZRS4 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC129Q6ZRS4 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC129Q6ZRS4 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC129Q6ZRS4 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC129Q6ZRS4 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC129Q6ZRS4 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC129Q6ZRS4 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC129Q6ZRS4 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC129Q6ZRS4 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC129Q6ZRS4 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC129Q6ZRS4 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC129Q6ZRS4 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC129Q6ZRS4 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC129Q6ZRS4 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC129Q6ZRS4 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC129Q6ZRS4 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC129Q6ZRS4 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC129Q6ZRS4 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC129Q6ZRS4 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC129Q6ZRS4 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC129Q6ZRS4 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC129Q6ZRS4 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC129Q6ZRS4 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC129Q6ZRS4 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC129Q6ZRS4 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC129Q6ZRS4 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC129Q6ZRS4 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC129Q6ZRS4 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC129Q6ZRS4 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CCDC129Q6ZRS4 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC129Q6ZRS4 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC129Q6ZRS4 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC129Q6ZRS4 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC129Q6ZRS4 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC129Q6ZRS4 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC129Q6ZRS4 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC129Q6ZRS4 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC129Q6ZRS4 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC129Q6ZRS4 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC129Q6ZRS4 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC129Q6ZRS4 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC129Q6ZRS4 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC129Q6ZRS4 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC129Q6ZRS4 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC129Q6ZRS4 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC129Q6ZRS4 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC129Q6ZRS4 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC129Q6ZRS4 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC129Q6ZRS4 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms