Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMU5

TRIM72, Tripartite motif-containing protein 72, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM72Q6ZMU5 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM72Q6ZMU5 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM72Q6ZMU5 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM72Q6ZMU5 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM72Q6ZMU5 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM72Q6ZMU5 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM72Q6ZMU5 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM72Q6ZMU5 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM72Q6ZMU5 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM72Q6ZMU5 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM72Q6ZMU5 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM72Q6ZMU5 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM72Q6ZMU5 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM72Q6ZMU5 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM72Q6ZMU5 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM72Q6ZMU5 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM72Q6ZMU5 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM72Q6ZMU5 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM72Q6ZMU5 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM72Q6ZMU5 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM72Q6ZMU5 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM72Q6ZMU5 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM72Q6ZMU5 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM72Q6ZMU5 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM72Q6ZMU5 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM72Q6ZMU5 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM72Q6ZMU5 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM72Q6ZMU5 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM72Q6ZMU5 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM72Q6ZMU5 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM72Q6ZMU5 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM72Q6ZMU5 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM72Q6ZMU5 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM72Q6ZMU5 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM72Q6ZMU5 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM72Q6ZMU5 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM72Q6ZMU5 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM72Q6ZMU5 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM72Q6ZMU5 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM72Q6ZMU5 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM72Q6ZMU5 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM72Q6ZMU5 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM72Q6ZMU5 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM72Q6ZMU5 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM72Q6ZMU5 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM72Q6ZMU5 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM72Q6ZMU5 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM72Q6ZMU5 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM72Q6ZMU5 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM72Q6ZMU5 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM72Q6ZMU5 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM72Q6ZMU5 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM72Q6ZMU5 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM72Q6ZMU5 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM72Q6ZMU5 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM72Q6ZMU5 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM72Q6ZMU5 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
TRIM72Q6ZMU5 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM72Q6ZMU5 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM72Q6ZMU5 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM72Q6ZMU5 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM72Q6ZMU5 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM72Q6ZMU5 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM72Q6ZMU5 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM72Q6ZMU5 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM72Q6ZMU5 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM72Q6ZMU5 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM72Q6ZMU5 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM72Q6ZMU5 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM72Q6ZMU5 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM72Q6ZMU5 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM72Q6ZMU5 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM72Q6ZMU5 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM72Q6ZMU5 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM72Q6ZMU5 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM72Q6ZMU5 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM72Q6ZMU5 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM72Q6ZMU5 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM72Q6ZMU5 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM72Q6ZMU5 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM72Q6ZMU5 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM72Q6ZMU5 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM72Q6ZMU5 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM72Q6ZMU5 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM72Q6ZMU5 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM72Q6ZMU5 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM72Q6ZMU5 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM72Q6ZMU5 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM72Q6ZMU5 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM72Q6ZMU5 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM72Q6ZMU5 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM72Q6ZMU5 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM72Q6ZMU5 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM72Q6ZMU5 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM72Q6ZMU5 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM72Q6ZMU5 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM72Q6ZMU5 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM72Q6ZMU5 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM72Q6ZMU5 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM72Q6ZMU5 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms