Protein–RNA interactions for Protein: Q6VMQ6

ATF7IP, Activating transcription factor 7-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF7IPQ6VMQ6 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ATF7IPQ6VMQ6 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ATF7IPQ6VMQ6 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ATF7IPQ6VMQ6 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ATF7IPQ6VMQ6 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ATF7IPQ6VMQ6 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
ATF7IPQ6VMQ6 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ATF7IPQ6VMQ6 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ATF7IPQ6VMQ6 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ATF7IPQ6VMQ6 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ATF7IPQ6VMQ6 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ATF7IPQ6VMQ6 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ATF7IPQ6VMQ6 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
ATF7IPQ6VMQ6 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ATF7IPQ6VMQ6 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ATF7IPQ6VMQ6 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ATF7IPQ6VMQ6 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ATF7IPQ6VMQ6 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ATF7IPQ6VMQ6 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ATF7IPQ6VMQ6 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ATF7IPQ6VMQ6 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ATF7IPQ6VMQ6 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ATF7IPQ6VMQ6 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ATF7IPQ6VMQ6 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ATF7IPQ6VMQ6 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ATF7IPQ6VMQ6 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
ATF7IPQ6VMQ6 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ATF7IPQ6VMQ6 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ATF7IPQ6VMQ6 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ATF7IPQ6VMQ6 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.26
ATF7IPQ6VMQ6 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ATF7IPQ6VMQ6 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
ATF7IPQ6VMQ6 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.25
ATF7IPQ6VMQ6 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
ATF7IPQ6VMQ6 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
ATF7IPQ6VMQ6 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ATF7IPQ6VMQ6 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ATF7IPQ6VMQ6 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
ATF7IPQ6VMQ6 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ATF7IPQ6VMQ6 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ATF7IPQ6VMQ6 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ATF7IPQ6VMQ6 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ATF7IPQ6VMQ6 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ATF7IPQ6VMQ6 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ATF7IPQ6VMQ6 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ATF7IPQ6VMQ6 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ATF7IPQ6VMQ6 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ATF7IPQ6VMQ6 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ATF7IPQ6VMQ6 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ATF7IPQ6VMQ6 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ATF7IPQ6VMQ6 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ATF7IPQ6VMQ6 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ATF7IPQ6VMQ6 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ATF7IPQ6VMQ6 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ATF7IPQ6VMQ6 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ATF7IPQ6VMQ6 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ATF7IPQ6VMQ6 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ATF7IPQ6VMQ6 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ATF7IPQ6VMQ6 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ATF7IPQ6VMQ6 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ATF7IPQ6VMQ6 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ATF7IPQ6VMQ6 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
ATF7IPQ6VMQ6 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ATF7IPQ6VMQ6 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ATF7IPQ6VMQ6 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ATF7IPQ6VMQ6 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ATF7IPQ6VMQ6 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ATF7IPQ6VMQ6 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ATF7IPQ6VMQ6 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ATF7IPQ6VMQ6 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ATF7IPQ6VMQ6 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ATF7IPQ6VMQ6 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ATF7IPQ6VMQ6 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ATF7IPQ6VMQ6 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ATF7IPQ6VMQ6 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ATF7IPQ6VMQ6 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ATF7IPQ6VMQ6 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ATF7IPQ6VMQ6 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ATF7IPQ6VMQ6 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ATF7IPQ6VMQ6 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ATF7IPQ6VMQ6 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ATF7IPQ6VMQ6 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ATF7IPQ6VMQ6 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ATF7IPQ6VMQ6 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ATF7IPQ6VMQ6 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ATF7IPQ6VMQ6 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ATF7IPQ6VMQ6 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ATF7IPQ6VMQ6 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ATF7IPQ6VMQ6 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ATF7IPQ6VMQ6 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ATF7IPQ6VMQ6 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ATF7IPQ6VMQ6 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ATF7IPQ6VMQ6 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ATF7IPQ6VMQ6 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ATF7IPQ6VMQ6 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ATF7IPQ6VMQ6 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ATF7IPQ6VMQ6 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ATF7IPQ6VMQ6 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ATF7IPQ6VMQ6 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ATF7IPQ6VMQ6 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms