Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRIG3Q6UXM1 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRIG3Q6UXM1 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
LRIG3Q6UXM1 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRIG3Q6UXM1 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRIG3Q6UXM1 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRIG3Q6UXM1 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRIG3Q6UXM1 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRIG3Q6UXM1 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRIG3Q6UXM1 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRIG3Q6UXM1 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRIG3Q6UXM1 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRIG3Q6UXM1 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRIG3Q6UXM1 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRIG3Q6UXM1 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRIG3Q6UXM1 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
LRIG3Q6UXM1 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRIG3Q6UXM1 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRIG3Q6UXM1 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRIG3Q6UXM1 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRIG3Q6UXM1 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRIG3Q6UXM1 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRIG3Q6UXM1 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
LRIG3Q6UXM1 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRIG3Q6UXM1 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRIG3Q6UXM1 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRIG3Q6UXM1 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRIG3Q6UXM1 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRIG3Q6UXM1 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRIG3Q6UXM1 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRIG3Q6UXM1 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRIG3Q6UXM1 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
LRIG3Q6UXM1 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRIG3Q6UXM1 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRIG3Q6UXM1 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRIG3Q6UXM1 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRIG3Q6UXM1 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRIG3Q6UXM1 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRIG3Q6UXM1 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRIG3Q6UXM1 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRIG3Q6UXM1 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRIG3Q6UXM1 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRIG3Q6UXM1 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRIG3Q6UXM1 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRIG3Q6UXM1 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRIG3Q6UXM1 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
LRIG3Q6UXM1 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRIG3Q6UXM1 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRIG3Q6UXM1 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRIG3Q6UXM1 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRIG3Q6UXM1 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRIG3Q6UXM1 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRIG3Q6UXM1 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRIG3Q6UXM1 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRIG3Q6UXM1 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRIG3Q6UXM1 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRIG3Q6UXM1 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRIG3Q6UXM1 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRIG3Q6UXM1 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRIG3Q6UXM1 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRIG3Q6UXM1 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRIG3Q6UXM1 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRIG3Q6UXM1 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRIG3Q6UXM1 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRIG3Q6UXM1 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRIG3Q6UXM1 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRIG3Q6UXM1 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRIG3Q6UXM1 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRIG3Q6UXM1 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRIG3Q6UXM1 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRIG3Q6UXM1 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
LRIG3Q6UXM1 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRIG3Q6UXM1 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRIG3Q6UXM1 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
LRIG3Q6UXM1 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRIG3Q6UXM1 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRIG3Q6UXM1 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRIG3Q6UXM1 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRIG3Q6UXM1 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRIG3Q6UXM1 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRIG3Q6UXM1 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRIG3Q6UXM1 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRIG3Q6UXM1 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRIG3Q6UXM1 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRIG3Q6UXM1 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRIG3Q6UXM1 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRIG3Q6UXM1 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRIG3Q6UXM1 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRIG3Q6UXM1 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRIG3Q6UXM1 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRIG3Q6UXM1 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRIG3Q6UXM1 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRIG3Q6UXM1 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRIG3Q6UXM1 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRIG3Q6UXM1 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRIG3Q6UXM1 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRIG3Q6UXM1 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRIG3Q6UXM1 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
LRIG3Q6UXM1 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRIG3Q6UXM1 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms