Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWP8

SBSN, Suprabasin, humanhuman

Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBSNQ6UWP8 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SBSNQ6UWP8 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SBSNQ6UWP8 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SBSNQ6UWP8 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SBSNQ6UWP8 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SBSNQ6UWP8 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SBSNQ6UWP8 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SBSNQ6UWP8 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SBSNQ6UWP8 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SBSNQ6UWP8 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SBSNQ6UWP8 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SBSNQ6UWP8 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SBSNQ6UWP8 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SBSNQ6UWP8 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SBSNQ6UWP8 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SBSNQ6UWP8 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SBSNQ6UWP8 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SBSNQ6UWP8 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SBSNQ6UWP8 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SBSNQ6UWP8 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SBSNQ6UWP8 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SBSNQ6UWP8 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SBSNQ6UWP8 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SBSNQ6UWP8 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SBSNQ6UWP8 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SBSNQ6UWP8 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SBSNQ6UWP8 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SBSNQ6UWP8 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SBSNQ6UWP8 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SBSNQ6UWP8 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SBSNQ6UWP8 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SBSNQ6UWP8 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SBSNQ6UWP8 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SBSNQ6UWP8 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SBSNQ6UWP8 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SBSNQ6UWP8 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SBSNQ6UWP8 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SBSNQ6UWP8 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SBSNQ6UWP8 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SBSNQ6UWP8 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SBSNQ6UWP8 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SBSNQ6UWP8 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SBSNQ6UWP8 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SBSNQ6UWP8 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SBSNQ6UWP8 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SBSNQ6UWP8 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SBSNQ6UWP8 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SBSNQ6UWP8 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SBSNQ6UWP8 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SBSNQ6UWP8 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SBSNQ6UWP8 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SBSNQ6UWP8 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SBSNQ6UWP8 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SBSNQ6UWP8 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SBSNQ6UWP8 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SBSNQ6UWP8 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SBSNQ6UWP8 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SBSNQ6UWP8 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SBSNQ6UWP8 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SBSNQ6UWP8 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SBSNQ6UWP8 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SBSNQ6UWP8 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SBSNQ6UWP8 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SBSNQ6UWP8 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SBSNQ6UWP8 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SBSNQ6UWP8 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SBSNQ6UWP8 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SBSNQ6UWP8 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SBSNQ6UWP8 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SBSNQ6UWP8 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SBSNQ6UWP8 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SBSNQ6UWP8 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SBSNQ6UWP8 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SBSNQ6UWP8 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SBSNQ6UWP8 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SBSNQ6UWP8 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SBSNQ6UWP8 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SBSNQ6UWP8 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SBSNQ6UWP8 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SBSNQ6UWP8 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SBSNQ6UWP8 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SBSNQ6UWP8 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SBSNQ6UWP8 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SBSNQ6UWP8 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SBSNQ6UWP8 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SBSNQ6UWP8 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SBSNQ6UWP8 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SBSNQ6UWP8 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SBSNQ6UWP8 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SBSNQ6UWP8 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SBSNQ6UWP8 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SBSNQ6UWP8 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SBSNQ6UWP8 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SBSNQ6UWP8 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SBSNQ6UWP8 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SBSNQ6UWP8 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SBSNQ6UWP8 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SBSNQ6UWP8 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SBSNQ6UWP8 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SBSNQ6UWP8 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms