Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWL2

SUSD1, Sushi domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD1Q6UWL2 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SUSD1Q6UWL2 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SUSD1Q6UWL2 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SUSD1Q6UWL2 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SUSD1Q6UWL2 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SUSD1Q6UWL2 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SUSD1Q6UWL2 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SUSD1Q6UWL2 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SUSD1Q6UWL2 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SUSD1Q6UWL2 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SUSD1Q6UWL2 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SUSD1Q6UWL2 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SUSD1Q6UWL2 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SUSD1Q6UWL2 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SUSD1Q6UWL2 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SUSD1Q6UWL2 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SUSD1Q6UWL2 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SUSD1Q6UWL2 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SUSD1Q6UWL2 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SUSD1Q6UWL2 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SUSD1Q6UWL2 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SUSD1Q6UWL2 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SUSD1Q6UWL2 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SUSD1Q6UWL2 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SUSD1Q6UWL2 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SUSD1Q6UWL2 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SUSD1Q6UWL2 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SUSD1Q6UWL2 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SUSD1Q6UWL2 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SUSD1Q6UWL2 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SUSD1Q6UWL2 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SUSD1Q6UWL2 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SUSD1Q6UWL2 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SUSD1Q6UWL2 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SUSD1Q6UWL2 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SUSD1Q6UWL2 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SUSD1Q6UWL2 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SUSD1Q6UWL2 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SUSD1Q6UWL2 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SUSD1Q6UWL2 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SUSD1Q6UWL2 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SUSD1Q6UWL2 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SUSD1Q6UWL2 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SUSD1Q6UWL2 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SUSD1Q6UWL2 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SUSD1Q6UWL2 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SUSD1Q6UWL2 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SUSD1Q6UWL2 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SUSD1Q6UWL2 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SUSD1Q6UWL2 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SUSD1Q6UWL2 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SUSD1Q6UWL2 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SUSD1Q6UWL2 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SUSD1Q6UWL2 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SUSD1Q6UWL2 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SUSD1Q6UWL2 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SUSD1Q6UWL2 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SUSD1Q6UWL2 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SUSD1Q6UWL2 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SUSD1Q6UWL2 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SUSD1Q6UWL2 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SUSD1Q6UWL2 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SUSD1Q6UWL2 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SUSD1Q6UWL2 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SUSD1Q6UWL2 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SUSD1Q6UWL2 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SUSD1Q6UWL2 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SUSD1Q6UWL2 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SUSD1Q6UWL2 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SUSD1Q6UWL2 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SUSD1Q6UWL2 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SUSD1Q6UWL2 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SUSD1Q6UWL2 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SUSD1Q6UWL2 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SUSD1Q6UWL2 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SUSD1Q6UWL2 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SUSD1Q6UWL2 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SUSD1Q6UWL2 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SUSD1Q6UWL2 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SUSD1Q6UWL2 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SUSD1Q6UWL2 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SUSD1Q6UWL2 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SUSD1Q6UWL2 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SUSD1Q6UWL2 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SUSD1Q6UWL2 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SUSD1Q6UWL2 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SUSD1Q6UWL2 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SUSD1Q6UWL2 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SUSD1Q6UWL2 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SUSD1Q6UWL2 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SUSD1Q6UWL2 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SUSD1Q6UWL2 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SUSD1Q6UWL2 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SUSD1Q6UWL2 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SUSD1Q6UWL2 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SUSD1Q6UWL2 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SUSD1Q6UWL2 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SUSD1Q6UWL2 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SUSD1Q6UWL2 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SUSD1Q6UWL2 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms