Protein–RNA interactions for Protein: Q6U841

SLC4A10, Sodium-driven chloride bicarbonate exchanger, humanhuman

Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A10Q6U841 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SLC4A10Q6U841 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SLC4A10Q6U841 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SLC4A10Q6U841 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SLC4A10Q6U841 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SLC4A10Q6U841 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SLC4A10Q6U841 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SLC4A10Q6U841 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SLC4A10Q6U841 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SLC4A10Q6U841 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SLC4A10Q6U841 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SLC4A10Q6U841 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SLC4A10Q6U841 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SLC4A10Q6U841 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SLC4A10Q6U841 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SLC4A10Q6U841 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SLC4A10Q6U841 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SLC4A10Q6U841 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SLC4A10Q6U841 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SLC4A10Q6U841 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SLC4A10Q6U841 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SLC4A10Q6U841 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SLC4A10Q6U841 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SLC4A10Q6U841 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SLC4A10Q6U841 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SLC4A10Q6U841 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SLC4A10Q6U841 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SLC4A10Q6U841 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SLC4A10Q6U841 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SLC4A10Q6U841 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SLC4A10Q6U841 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SLC4A10Q6U841 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SLC4A10Q6U841 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SLC4A10Q6U841 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SLC4A10Q6U841 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SLC4A10Q6U841 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
SLC4A10Q6U841 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SLC4A10Q6U841 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SLC4A10Q6U841 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SLC4A10Q6U841 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SLC4A10Q6U841 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SLC4A10Q6U841 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SLC4A10Q6U841 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SLC4A10Q6U841 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SLC4A10Q6U841 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SLC4A10Q6U841 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
SLC4A10Q6U841 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
SLC4A10Q6U841 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SLC4A10Q6U841 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
SLC4A10Q6U841 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SLC4A10Q6U841 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SLC4A10Q6U841 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
SLC4A10Q6U841 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SLC4A10Q6U841 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
SLC4A10Q6U841 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
SLC4A10Q6U841 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
SLC4A10Q6U841 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
SLC4A10Q6U841 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SLC4A10Q6U841 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SLC4A10Q6U841 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
SLC4A10Q6U841 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SLC4A10Q6U841 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SLC4A10Q6U841 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SLC4A10Q6U841 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SLC4A10Q6U841 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SLC4A10Q6U841 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SLC4A10Q6U841 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SLC4A10Q6U841 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SLC4A10Q6U841 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SLC4A10Q6U841 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SLC4A10Q6U841 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SLC4A10Q6U841 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SLC4A10Q6U841 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SLC4A10Q6U841 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SLC4A10Q6U841 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SLC4A10Q6U841 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SLC4A10Q6U841 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SLC4A10Q6U841 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SLC4A10Q6U841 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SLC4A10Q6U841 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SLC4A10Q6U841 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SLC4A10Q6U841 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SLC4A10Q6U841 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SLC4A10Q6U841 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SLC4A10Q6U841 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SLC4A10Q6U841 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SLC4A10Q6U841 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SLC4A10Q6U841 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
SLC4A10Q6U841 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
SLC4A10Q6U841 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
SLC4A10Q6U841 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
SLC4A10Q6U841 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
SLC4A10Q6U841 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
SLC4A10Q6U841 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SLC4A10Q6U841 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SLC4A10Q6U841 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SLC4A10Q6U841 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SLC4A10Q6U841 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
SLC4A10Q6U841 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SLC4A10Q6U841 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms