Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C1

SLC25A47, Solute carrier family 25 member 47, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A47Q6Q0C1 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC25A47Q6Q0C1 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC25A47Q6Q0C1 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC25A47Q6Q0C1 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC25A47Q6Q0C1 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC25A47Q6Q0C1 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC25A47Q6Q0C1 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC25A47Q6Q0C1 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC25A47Q6Q0C1 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC25A47Q6Q0C1 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC25A47Q6Q0C1 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC25A47Q6Q0C1 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC25A47Q6Q0C1 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC25A47Q6Q0C1 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC25A47Q6Q0C1 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC25A47Q6Q0C1 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC25A47Q6Q0C1 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC25A47Q6Q0C1 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC25A47Q6Q0C1 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC25A47Q6Q0C1 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC25A47Q6Q0C1 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC25A47Q6Q0C1 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC25A47Q6Q0C1 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC25A47Q6Q0C1 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC25A47Q6Q0C1 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC25A47Q6Q0C1 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC25A47Q6Q0C1 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC25A47Q6Q0C1 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC25A47Q6Q0C1 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC25A47Q6Q0C1 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC25A47Q6Q0C1 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC25A47Q6Q0C1 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC25A47Q6Q0C1 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC25A47Q6Q0C1 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC25A47Q6Q0C1 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC25A47Q6Q0C1 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC25A47Q6Q0C1 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC25A47Q6Q0C1 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC25A47Q6Q0C1 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC25A47Q6Q0C1 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC25A47Q6Q0C1 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC25A47Q6Q0C1 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC25A47Q6Q0C1 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC25A47Q6Q0C1 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC25A47Q6Q0C1 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC25A47Q6Q0C1 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC25A47Q6Q0C1 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC25A47Q6Q0C1 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC25A47Q6Q0C1 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC25A47Q6Q0C1 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC25A47Q6Q0C1 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC25A47Q6Q0C1 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC25A47Q6Q0C1 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC25A47Q6Q0C1 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC25A47Q6Q0C1 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC25A47Q6Q0C1 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC25A47Q6Q0C1 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC25A47Q6Q0C1 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC25A47Q6Q0C1 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC25A47Q6Q0C1 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC25A47Q6Q0C1 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC25A47Q6Q0C1 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC25A47Q6Q0C1 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC25A47Q6Q0C1 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC25A47Q6Q0C1 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC25A47Q6Q0C1 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC25A47Q6Q0C1 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC25A47Q6Q0C1 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC25A47Q6Q0C1 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC25A47Q6Q0C1 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC25A47Q6Q0C1 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC25A47Q6Q0C1 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SLC25A47Q6Q0C1 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SLC25A47Q6Q0C1 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SLC25A47Q6Q0C1 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC25A47Q6Q0C1 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC25A47Q6Q0C1 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC25A47Q6Q0C1 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC25A47Q6Q0C1 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC25A47Q6Q0C1 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC25A47Q6Q0C1 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC25A47Q6Q0C1 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC25A47Q6Q0C1 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC25A47Q6Q0C1 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC25A47Q6Q0C1 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC25A47Q6Q0C1 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC25A47Q6Q0C1 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC25A47Q6Q0C1 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC25A47Q6Q0C1 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC25A47Q6Q0C1 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC25A47Q6Q0C1 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC25A47Q6Q0C1 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC25A47Q6Q0C1 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC25A47Q6Q0C1 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC25A47Q6Q0C1 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC25A47Q6Q0C1 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC25A47Q6Q0C1 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC25A47Q6Q0C1 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC25A47Q6Q0C1 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC25A47Q6Q0C1 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms