Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD62

CTR9, RNA polymerase-associated protein CTR9 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTR9Q6PD62 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CTR9Q6PD62 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CTR9Q6PD62 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CTR9Q6PD62 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CTR9Q6PD62 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CTR9Q6PD62 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CTR9Q6PD62 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CTR9Q6PD62 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CTR9Q6PD62 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CTR9Q6PD62 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CTR9Q6PD62 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CTR9Q6PD62 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CTR9Q6PD62 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CTR9Q6PD62 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CTR9Q6PD62 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CTR9Q6PD62 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CTR9Q6PD62 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.96
CTR9Q6PD62 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CTR9Q6PD62 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
CTR9Q6PD62 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CTR9Q6PD62 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CTR9Q6PD62 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CTR9Q6PD62 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CTR9Q6PD62 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CTR9Q6PD62 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CTR9Q6PD62 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CTR9Q6PD62 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CTR9Q6PD62 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CTR9Q6PD62 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CTR9Q6PD62 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CTR9Q6PD62 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
CTR9Q6PD62 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CTR9Q6PD62 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CTR9Q6PD62 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CTR9Q6PD62 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CTR9Q6PD62 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CTR9Q6PD62 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CTR9Q6PD62 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CTR9Q6PD62 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CTR9Q6PD62 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CTR9Q6PD62 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CTR9Q6PD62 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CTR9Q6PD62 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CTR9Q6PD62 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CTR9Q6PD62 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CTR9Q6PD62 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CTR9Q6PD62 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CTR9Q6PD62 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CTR9Q6PD62 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CTR9Q6PD62 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CTR9Q6PD62 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CTR9Q6PD62 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CTR9Q6PD62 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CTR9Q6PD62 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CTR9Q6PD62 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CTR9Q6PD62 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CTR9Q6PD62 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CTR9Q6PD62 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CTR9Q6PD62 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CTR9Q6PD62 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CTR9Q6PD62 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
CTR9Q6PD62 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CTR9Q6PD62 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CTR9Q6PD62 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CTR9Q6PD62 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CTR9Q6PD62 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CTR9Q6PD62 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CTR9Q6PD62 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CTR9Q6PD62 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CTR9Q6PD62 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CTR9Q6PD62 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CTR9Q6PD62 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CTR9Q6PD62 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CTR9Q6PD62 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CTR9Q6PD62 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CTR9Q6PD62 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CTR9Q6PD62 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CTR9Q6PD62 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CTR9Q6PD62 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CTR9Q6PD62 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CTR9Q6PD62 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CTR9Q6PD62 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CTR9Q6PD62 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CTR9Q6PD62 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CTR9Q6PD62 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CTR9Q6PD62 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CTR9Q6PD62 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CTR9Q6PD62 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CTR9Q6PD62 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CTR9Q6PD62 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CTR9Q6PD62 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CTR9Q6PD62 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CTR9Q6PD62 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CTR9Q6PD62 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CTR9Q6PD62 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CTR9Q6PD62 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CTR9Q6PD62 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CTR9Q6PD62 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CTR9Q6PD62 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CTR9Q6PD62 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms