Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCB7

SLC27A1, Long-chain fatty acid transport protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A1Q6PCB7 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC27A1Q6PCB7 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC27A1Q6PCB7 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC27A1Q6PCB7 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC27A1Q6PCB7 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC27A1Q6PCB7 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC27A1Q6PCB7 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC27A1Q6PCB7 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC27A1Q6PCB7 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC27A1Q6PCB7 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC27A1Q6PCB7 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC27A1Q6PCB7 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC27A1Q6PCB7 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC27A1Q6PCB7 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC27A1Q6PCB7 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC27A1Q6PCB7 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC27A1Q6PCB7 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC27A1Q6PCB7 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC27A1Q6PCB7 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC27A1Q6PCB7 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC27A1Q6PCB7 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC27A1Q6PCB7 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC27A1Q6PCB7 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC27A1Q6PCB7 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC27A1Q6PCB7 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC27A1Q6PCB7 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC27A1Q6PCB7 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC27A1Q6PCB7 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC27A1Q6PCB7 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC27A1Q6PCB7 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC27A1Q6PCB7 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC27A1Q6PCB7 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC27A1Q6PCB7 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC27A1Q6PCB7 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC27A1Q6PCB7 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC27A1Q6PCB7 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC27A1Q6PCB7 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC27A1Q6PCB7 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC27A1Q6PCB7 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC27A1Q6PCB7 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC27A1Q6PCB7 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC27A1Q6PCB7 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC27A1Q6PCB7 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC27A1Q6PCB7 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC27A1Q6PCB7 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC27A1Q6PCB7 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC27A1Q6PCB7 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC27A1Q6PCB7 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC27A1Q6PCB7 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC27A1Q6PCB7 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC27A1Q6PCB7 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC27A1Q6PCB7 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC27A1Q6PCB7 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC27A1Q6PCB7 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC27A1Q6PCB7 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC27A1Q6PCB7 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC27A1Q6PCB7 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC27A1Q6PCB7 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC27A1Q6PCB7 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC27A1Q6PCB7 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SLC27A1Q6PCB7 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SLC27A1Q6PCB7 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC27A1Q6PCB7 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC27A1Q6PCB7 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC27A1Q6PCB7 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC27A1Q6PCB7 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC27A1Q6PCB7 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC27A1Q6PCB7 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC27A1Q6PCB7 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC27A1Q6PCB7 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC27A1Q6PCB7 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC27A1Q6PCB7 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC27A1Q6PCB7 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC27A1Q6PCB7 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC27A1Q6PCB7 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC27A1Q6PCB7 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC27A1Q6PCB7 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC27A1Q6PCB7 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC27A1Q6PCB7 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC27A1Q6PCB7 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC27A1Q6PCB7 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC27A1Q6PCB7 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC27A1Q6PCB7 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC27A1Q6PCB7 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC27A1Q6PCB7 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC27A1Q6PCB7 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC27A1Q6PCB7 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC27A1Q6PCB7 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC27A1Q6PCB7 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC27A1Q6PCB7 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC27A1Q6PCB7 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC27A1Q6PCB7 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC27A1Q6PCB7 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC27A1Q6PCB7 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC27A1Q6PCB7 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC27A1Q6PCB7 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC27A1Q6PCB7 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC27A1Q6PCB7 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC27A1Q6PCB7 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC27A1Q6PCB7 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81 ms