Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4E1

CASC4, Protein CASC4, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC4Q6P4E1 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CASC4Q6P4E1 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CASC4Q6P4E1 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CASC4Q6P4E1 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CASC4Q6P4E1 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CASC4Q6P4E1 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CASC4Q6P4E1 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CASC4Q6P4E1 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CASC4Q6P4E1 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CASC4Q6P4E1 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CASC4Q6P4E1 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CASC4Q6P4E1 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CASC4Q6P4E1 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CASC4Q6P4E1 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CASC4Q6P4E1 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CASC4Q6P4E1 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CASC4Q6P4E1 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CASC4Q6P4E1 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CASC4Q6P4E1 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CASC4Q6P4E1 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CASC4Q6P4E1 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CASC4Q6P4E1 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CASC4Q6P4E1 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CASC4Q6P4E1 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CASC4Q6P4E1 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CASC4Q6P4E1 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CASC4Q6P4E1 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CASC4Q6P4E1 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CASC4Q6P4E1 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CASC4Q6P4E1 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CASC4Q6P4E1 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CASC4Q6P4E1 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CASC4Q6P4E1 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CASC4Q6P4E1 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CASC4Q6P4E1 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CASC4Q6P4E1 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CASC4Q6P4E1 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CASC4Q6P4E1 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CASC4Q6P4E1 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CASC4Q6P4E1 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CASC4Q6P4E1 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CASC4Q6P4E1 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CASC4Q6P4E1 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CASC4Q6P4E1 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CASC4Q6P4E1 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CASC4Q6P4E1 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CASC4Q6P4E1 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CASC4Q6P4E1 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CASC4Q6P4E1 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CASC4Q6P4E1 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CASC4Q6P4E1 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CASC4Q6P4E1 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CASC4Q6P4E1 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CASC4Q6P4E1 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CASC4Q6P4E1 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CASC4Q6P4E1 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CASC4Q6P4E1 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CASC4Q6P4E1 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CASC4Q6P4E1 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CASC4Q6P4E1 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CASC4Q6P4E1 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CASC4Q6P4E1 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CASC4Q6P4E1 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CASC4Q6P4E1 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CASC4Q6P4E1 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CASC4Q6P4E1 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CASC4Q6P4E1 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CASC4Q6P4E1 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CASC4Q6P4E1 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CASC4Q6P4E1 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CASC4Q6P4E1 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CASC4Q6P4E1 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CASC4Q6P4E1 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CASC4Q6P4E1 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CASC4Q6P4E1 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CASC4Q6P4E1 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CASC4Q6P4E1 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CASC4Q6P4E1 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CASC4Q6P4E1 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CASC4Q6P4E1 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CASC4Q6P4E1 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CASC4Q6P4E1 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CASC4Q6P4E1 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CASC4Q6P4E1 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CASC4Q6P4E1 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CASC4Q6P4E1 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CASC4Q6P4E1 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CASC4Q6P4E1 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CASC4Q6P4E1 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CASC4Q6P4E1 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CASC4Q6P4E1 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CASC4Q6P4E1 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CASC4Q6P4E1 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CASC4Q6P4E1 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CASC4Q6P4E1 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CASC4Q6P4E1 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CASC4Q6P4E1 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CASC4Q6P4E1 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CASC4Q6P4E1 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CASC4Q6P4E1 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.4 ms