Protein–RNA interactions for Protein: Q6NY19

KANK3, KN motif and ankyrin repeat domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 840 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KANK3Q6NY19 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
KANK3Q6NY19 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
KANK3Q6NY19 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
KANK3Q6NY19 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KANK3Q6NY19 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
KANK3Q6NY19 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
KANK3Q6NY19 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KANK3Q6NY19 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KANK3Q6NY19 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
KANK3Q6NY19 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KANK3Q6NY19 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KANK3Q6NY19 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
KANK3Q6NY19 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
KANK3Q6NY19 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
KANK3Q6NY19 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
KANK3Q6NY19 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
KANK3Q6NY19 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
KANK3Q6NY19 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
KANK3Q6NY19 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
KANK3Q6NY19 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
KANK3Q6NY19 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
KANK3Q6NY19 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
KANK3Q6NY19 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
KANK3Q6NY19 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KANK3Q6NY19 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
KANK3Q6NY19 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KANK3Q6NY19 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
KANK3Q6NY19 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
KANK3Q6NY19 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
KANK3Q6NY19 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
KANK3Q6NY19 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
KANK3Q6NY19 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
KANK3Q6NY19 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
KANK3Q6NY19 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
KANK3Q6NY19 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
KANK3Q6NY19 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
KANK3Q6NY19 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
KANK3Q6NY19 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
KANK3Q6NY19 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
KANK3Q6NY19 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
KANK3Q6NY19 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
KANK3Q6NY19 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
KANK3Q6NY19 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
KANK3Q6NY19 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
KANK3Q6NY19 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
KANK3Q6NY19 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
KANK3Q6NY19 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
KANK3Q6NY19 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
KANK3Q6NY19 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
KANK3Q6NY19 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
KANK3Q6NY19 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
KANK3Q6NY19 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
KANK3Q6NY19 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
KANK3Q6NY19 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
KANK3Q6NY19 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
KANK3Q6NY19 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
KANK3Q6NY19 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
KANK3Q6NY19 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
KANK3Q6NY19 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
KANK3Q6NY19 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
KANK3Q6NY19 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
KANK3Q6NY19 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
KANK3Q6NY19 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
KANK3Q6NY19 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
KANK3Q6NY19 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
KANK3Q6NY19 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
KANK3Q6NY19 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
KANK3Q6NY19 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
KANK3Q6NY19 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KANK3Q6NY19 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
KANK3Q6NY19 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
KANK3Q6NY19 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
KANK3Q6NY19 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
KANK3Q6NY19 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
KANK3Q6NY19 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
KANK3Q6NY19 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
KANK3Q6NY19 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KANK3Q6NY19 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KANK3Q6NY19 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
KANK3Q6NY19 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
KANK3Q6NY19 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KANK3Q6NY19 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KANK3Q6NY19 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KANK3Q6NY19 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
KANK3Q6NY19 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
KANK3Q6NY19 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
KANK3Q6NY19 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KANK3Q6NY19 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KANK3Q6NY19 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
KANK3Q6NY19 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KANK3Q6NY19 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KANK3Q6NY19 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KANK3Q6NY19 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KANK3Q6NY19 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
KANK3Q6NY19 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KANK3Q6NY19 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KANK3Q6NY19 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
KANK3Q6NY19 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
KANK3Q6NY19 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KANK3Q6NY19 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms