Protein–RNA interactions for Protein: Q6NW40

RGMB, RGM domain family member B, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGMBQ6NW40 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RGMBQ6NW40 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RGMBQ6NW40 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RGMBQ6NW40 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RGMBQ6NW40 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RGMBQ6NW40 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RGMBQ6NW40 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RGMBQ6NW40 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RGMBQ6NW40 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RGMBQ6NW40 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RGMBQ6NW40 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RGMBQ6NW40 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RGMBQ6NW40 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
RGMBQ6NW40 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RGMBQ6NW40 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
RGMBQ6NW40 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RGMBQ6NW40 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RGMBQ6NW40 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RGMBQ6NW40 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
RGMBQ6NW40 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RGMBQ6NW40 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RGMBQ6NW40 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RGMBQ6NW40 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RGMBQ6NW40 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RGMBQ6NW40 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RGMBQ6NW40 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RGMBQ6NW40 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RGMBQ6NW40 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
RGMBQ6NW40 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RGMBQ6NW40 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RGMBQ6NW40 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RGMBQ6NW40 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RGMBQ6NW40 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RGMBQ6NW40 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RGMBQ6NW40 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RGMBQ6NW40 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RGMBQ6NW40 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RGMBQ6NW40 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RGMBQ6NW40 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RGMBQ6NW40 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RGMBQ6NW40 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RGMBQ6NW40 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RGMBQ6NW40 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
RGMBQ6NW40 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
RGMBQ6NW40 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
RGMBQ6NW40 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RGMBQ6NW40 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RGMBQ6NW40 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RGMBQ6NW40 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RGMBQ6NW40 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RGMBQ6NW40 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RGMBQ6NW40 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RGMBQ6NW40 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RGMBQ6NW40 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RGMBQ6NW40 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
RGMBQ6NW40 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RGMBQ6NW40 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RGMBQ6NW40 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RGMBQ6NW40 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RGMBQ6NW40 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RGMBQ6NW40 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RGMBQ6NW40 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RGMBQ6NW40 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
RGMBQ6NW40 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RGMBQ6NW40 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RGMBQ6NW40 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RGMBQ6NW40 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RGMBQ6NW40 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RGMBQ6NW40 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RGMBQ6NW40 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RGMBQ6NW40 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
RGMBQ6NW40 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RGMBQ6NW40 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RGMBQ6NW40 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RGMBQ6NW40 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RGMBQ6NW40 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RGMBQ6NW40 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RGMBQ6NW40 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RGMBQ6NW40 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RGMBQ6NW40 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
RGMBQ6NW40 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
RGMBQ6NW40 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RGMBQ6NW40 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RGMBQ6NW40 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RGMBQ6NW40 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RGMBQ6NW40 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RGMBQ6NW40 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RGMBQ6NW40 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RGMBQ6NW40 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RGMBQ6NW40 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RGMBQ6NW40 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RGMBQ6NW40 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RGMBQ6NW40 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RGMBQ6NW40 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RGMBQ6NW40 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RGMBQ6NW40 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RGMBQ6NW40 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RGMBQ6NW40 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RGMBQ6NW40 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RGMBQ6NW40 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms