Protein–RNA interactions for Protein: Q6NW34

NEPRO, Nucleolus and neural progenitor protein, humanhuman

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEPROQ6NW34 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEPROQ6NW34 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEPROQ6NW34 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEPROQ6NW34 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEPROQ6NW34 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NEPROQ6NW34 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NEPROQ6NW34 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NEPROQ6NW34 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NEPROQ6NW34 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NEPROQ6NW34 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NEPROQ6NW34 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NEPROQ6NW34 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
NEPROQ6NW34 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NEPROQ6NW34 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NEPROQ6NW34 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NEPROQ6NW34 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEPROQ6NW34 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEPROQ6NW34 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEPROQ6NW34 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEPROQ6NW34 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEPROQ6NW34 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEPROQ6NW34 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEPROQ6NW34 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEPROQ6NW34 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEPROQ6NW34 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEPROQ6NW34 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEPROQ6NW34 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEPROQ6NW34 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEPROQ6NW34 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEPROQ6NW34 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEPROQ6NW34 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEPROQ6NW34 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEPROQ6NW34 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEPROQ6NW34 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
NEPROQ6NW34 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEPROQ6NW34 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
NEPROQ6NW34 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEPROQ6NW34 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEPROQ6NW34 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEPROQ6NW34 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEPROQ6NW34 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEPROQ6NW34 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEPROQ6NW34 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
NEPROQ6NW34 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEPROQ6NW34 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEPROQ6NW34 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEPROQ6NW34 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEPROQ6NW34 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEPROQ6NW34 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEPROQ6NW34 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEPROQ6NW34 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEPROQ6NW34 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEPROQ6NW34 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEPROQ6NW34 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEPROQ6NW34 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEPROQ6NW34 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEPROQ6NW34 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEPROQ6NW34 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEPROQ6NW34 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEPROQ6NW34 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEPROQ6NW34 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEPROQ6NW34 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEPROQ6NW34 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEPROQ6NW34 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEPROQ6NW34 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEPROQ6NW34 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEPROQ6NW34 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEPROQ6NW34 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEPROQ6NW34 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEPROQ6NW34 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NEPROQ6NW34 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NEPROQ6NW34 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NEPROQ6NW34 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NEPROQ6NW34 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NEPROQ6NW34 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEPROQ6NW34 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NEPROQ6NW34 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEPROQ6NW34 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEPROQ6NW34 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEPROQ6NW34 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEPROQ6NW34 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEPROQ6NW34 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEPROQ6NW34 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEPROQ6NW34 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEPROQ6NW34 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEPROQ6NW34 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEPROQ6NW34 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEPROQ6NW34 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEPROQ6NW34 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NEPROQ6NW34 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEPROQ6NW34 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEPROQ6NW34 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEPROQ6NW34 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEPROQ6NW34 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NEPROQ6NW34 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEPROQ6NW34 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEPROQ6NW34 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEPROQ6NW34 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEPROQ6NW34 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEPROQ6NW34 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.9 ms