Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSJ5

LRRC8E, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8E, humanhuman

Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC8EQ6NSJ5 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC8EQ6NSJ5 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC8EQ6NSJ5 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC8EQ6NSJ5 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC8EQ6NSJ5 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC8EQ6NSJ5 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC8EQ6NSJ5 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC8EQ6NSJ5 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC8EQ6NSJ5 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC8EQ6NSJ5 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC8EQ6NSJ5 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC8EQ6NSJ5 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC8EQ6NSJ5 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC8EQ6NSJ5 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC8EQ6NSJ5 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRC8EQ6NSJ5 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRC8EQ6NSJ5 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRC8EQ6NSJ5 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRC8EQ6NSJ5 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRC8EQ6NSJ5 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRC8EQ6NSJ5 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRC8EQ6NSJ5 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRC8EQ6NSJ5 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRC8EQ6NSJ5 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRC8EQ6NSJ5 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRC8EQ6NSJ5 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRC8EQ6NSJ5 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRC8EQ6NSJ5 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRC8EQ6NSJ5 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRC8EQ6NSJ5 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRC8EQ6NSJ5 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRC8EQ6NSJ5 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRC8EQ6NSJ5 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRC8EQ6NSJ5 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRC8EQ6NSJ5 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRC8EQ6NSJ5 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRC8EQ6NSJ5 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRC8EQ6NSJ5 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC8EQ6NSJ5 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC8EQ6NSJ5 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC8EQ6NSJ5 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC8EQ6NSJ5 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC8EQ6NSJ5 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC8EQ6NSJ5 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC8EQ6NSJ5 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC8EQ6NSJ5 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC8EQ6NSJ5 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC8EQ6NSJ5 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC8EQ6NSJ5 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC8EQ6NSJ5 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC8EQ6NSJ5 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC8EQ6NSJ5 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC8EQ6NSJ5 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC8EQ6NSJ5 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC8EQ6NSJ5 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC8EQ6NSJ5 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC8EQ6NSJ5 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC8EQ6NSJ5 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC8EQ6NSJ5 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC8EQ6NSJ5 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC8EQ6NSJ5 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC8EQ6NSJ5 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC8EQ6NSJ5 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC8EQ6NSJ5 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC8EQ6NSJ5 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC8EQ6NSJ5 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC8EQ6NSJ5 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC8EQ6NSJ5 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC8EQ6NSJ5 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRC8EQ6NSJ5 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRC8EQ6NSJ5 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRC8EQ6NSJ5 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRC8EQ6NSJ5 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRC8EQ6NSJ5 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRC8EQ6NSJ5 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRC8EQ6NSJ5 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRC8EQ6NSJ5 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRC8EQ6NSJ5 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRC8EQ6NSJ5 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC8EQ6NSJ5 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC8EQ6NSJ5 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC8EQ6NSJ5 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC8EQ6NSJ5 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC8EQ6NSJ5 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC8EQ6NSJ5 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC8EQ6NSJ5 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC8EQ6NSJ5 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC8EQ6NSJ5 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
LRRC8EQ6NSJ5 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRC8EQ6NSJ5 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRC8EQ6NSJ5 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRC8EQ6NSJ5 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRC8EQ6NSJ5 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC8EQ6NSJ5 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC8EQ6NSJ5 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC8EQ6NSJ5 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC8EQ6NSJ5 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC8EQ6NSJ5 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC8EQ6NSJ5 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC8EQ6NSJ5 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms