Protein–RNA interactions for Protein: Q6J4K2

SLC8B1, Mitochondrial sodium/calcium exchanger protein, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC8B1Q6J4K2 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC8B1Q6J4K2 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC8B1Q6J4K2 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC8B1Q6J4K2 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC8B1Q6J4K2 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC8B1Q6J4K2 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC8B1Q6J4K2 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC8B1Q6J4K2 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC8B1Q6J4K2 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC8B1Q6J4K2 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC8B1Q6J4K2 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC8B1Q6J4K2 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC8B1Q6J4K2 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC8B1Q6J4K2 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC8B1Q6J4K2 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC8B1Q6J4K2 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC8B1Q6J4K2 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC8B1Q6J4K2 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC8B1Q6J4K2 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC8B1Q6J4K2 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC8B1Q6J4K2 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC8B1Q6J4K2 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC8B1Q6J4K2 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC8B1Q6J4K2 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC8B1Q6J4K2 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC8B1Q6J4K2 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC8B1Q6J4K2 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC8B1Q6J4K2 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC8B1Q6J4K2 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC8B1Q6J4K2 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC8B1Q6J4K2 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC8B1Q6J4K2 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC8B1Q6J4K2 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC8B1Q6J4K2 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC8B1Q6J4K2 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC8B1Q6J4K2 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC8B1Q6J4K2 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC8B1Q6J4K2 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC8B1Q6J4K2 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC8B1Q6J4K2 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC8B1Q6J4K2 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC8B1Q6J4K2 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC8B1Q6J4K2 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC8B1Q6J4K2 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC8B1Q6J4K2 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC8B1Q6J4K2 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC8B1Q6J4K2 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC8B1Q6J4K2 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC8B1Q6J4K2 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC8B1Q6J4K2 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC8B1Q6J4K2 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC8B1Q6J4K2 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC8B1Q6J4K2 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC8B1Q6J4K2 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC8B1Q6J4K2 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC8B1Q6J4K2 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC8B1Q6J4K2 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC8B1Q6J4K2 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC8B1Q6J4K2 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC8B1Q6J4K2 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC8B1Q6J4K2 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC8B1Q6J4K2 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC8B1Q6J4K2 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC8B1Q6J4K2 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC8B1Q6J4K2 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC8B1Q6J4K2 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC8B1Q6J4K2 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC8B1Q6J4K2 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC8B1Q6J4K2 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC8B1Q6J4K2 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC8B1Q6J4K2 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC8B1Q6J4K2 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC8B1Q6J4K2 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC8B1Q6J4K2 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC8B1Q6J4K2 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC8B1Q6J4K2 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC8B1Q6J4K2 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC8B1Q6J4K2 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC8B1Q6J4K2 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC8B1Q6J4K2 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC8B1Q6J4K2 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC8B1Q6J4K2 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC8B1Q6J4K2 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC8B1Q6J4K2 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC8B1Q6J4K2 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC8B1Q6J4K2 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC8B1Q6J4K2 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC8B1Q6J4K2 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC8B1Q6J4K2 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC8B1Q6J4K2 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC8B1Q6J4K2 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC8B1Q6J4K2 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC8B1Q6J4K2 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC8B1Q6J4K2 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC8B1Q6J4K2 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC8B1Q6J4K2 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC8B1Q6J4K2 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC8B1Q6J4K2 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC8B1Q6J4K2 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC8B1Q6J4K2 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms