Protein–RNA interactions for Protein: Q6GQQ9

OTUD7B, OTU domain-containing protein 7B, humanhuman

Predictions only

Length 843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD7BQ6GQQ9 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
OTUD7BQ6GQQ9 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
OTUD7BQ6GQQ9 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
OTUD7BQ6GQQ9 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
OTUD7BQ6GQQ9 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
OTUD7BQ6GQQ9 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
OTUD7BQ6GQQ9 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
OTUD7BQ6GQQ9 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
OTUD7BQ6GQQ9 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
OTUD7BQ6GQQ9 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
OTUD7BQ6GQQ9 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
OTUD7BQ6GQQ9 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
OTUD7BQ6GQQ9 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
OTUD7BQ6GQQ9 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
OTUD7BQ6GQQ9 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
OTUD7BQ6GQQ9 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
OTUD7BQ6GQQ9 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
OTUD7BQ6GQQ9 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
OTUD7BQ6GQQ9 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
OTUD7BQ6GQQ9 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
OTUD7BQ6GQQ9 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
OTUD7BQ6GQQ9 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
OTUD7BQ6GQQ9 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
OTUD7BQ6GQQ9 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC27.39■■□□□ 1.98
OTUD7BQ6GQQ9 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
OTUD7BQ6GQQ9 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
OTUD7BQ6GQQ9 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
OTUD7BQ6GQQ9 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
OTUD7BQ6GQQ9 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
OTUD7BQ6GQQ9 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
OTUD7BQ6GQQ9 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
OTUD7BQ6GQQ9 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
OTUD7BQ6GQQ9 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
OTUD7BQ6GQQ9 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
OTUD7BQ6GQQ9 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
OTUD7BQ6GQQ9 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
OTUD7BQ6GQQ9 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
OTUD7BQ6GQQ9 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
OTUD7BQ6GQQ9 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
OTUD7BQ6GQQ9 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
OTUD7BQ6GQQ9 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
OTUD7BQ6GQQ9 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
OTUD7BQ6GQQ9 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
OTUD7BQ6GQQ9 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
OTUD7BQ6GQQ9 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
OTUD7BQ6GQQ9 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
OTUD7BQ6GQQ9 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
OTUD7BQ6GQQ9 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
OTUD7BQ6GQQ9 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
OTUD7BQ6GQQ9 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
OTUD7BQ6GQQ9 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
OTUD7BQ6GQQ9 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
OTUD7BQ6GQQ9 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
OTUD7BQ6GQQ9 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
OTUD7BQ6GQQ9 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
OTUD7BQ6GQQ9 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
OTUD7BQ6GQQ9 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
OTUD7BQ6GQQ9 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
OTUD7BQ6GQQ9 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
OTUD7BQ6GQQ9 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
OTUD7BQ6GQQ9 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
OTUD7BQ6GQQ9 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
OTUD7BQ6GQQ9 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
OTUD7BQ6GQQ9 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
OTUD7BQ6GQQ9 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
OTUD7BQ6GQQ9 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
OTUD7BQ6GQQ9 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
OTUD7BQ6GQQ9 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
OTUD7BQ6GQQ9 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
OTUD7BQ6GQQ9 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
OTUD7BQ6GQQ9 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
OTUD7BQ6GQQ9 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
OTUD7BQ6GQQ9 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
OTUD7BQ6GQQ9 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
OTUD7BQ6GQQ9 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
OTUD7BQ6GQQ9 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
OTUD7BQ6GQQ9 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
OTUD7BQ6GQQ9 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
OTUD7BQ6GQQ9 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
OTUD7BQ6GQQ9 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
OTUD7BQ6GQQ9 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
OTUD7BQ6GQQ9 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
OTUD7BQ6GQQ9 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
OTUD7BQ6GQQ9 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
OTUD7BQ6GQQ9 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
OTUD7BQ6GQQ9 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
OTUD7BQ6GQQ9 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
OTUD7BQ6GQQ9 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
OTUD7BQ6GQQ9 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
OTUD7BQ6GQQ9 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
OTUD7BQ6GQQ9 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
OTUD7BQ6GQQ9 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
OTUD7BQ6GQQ9 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
OTUD7BQ6GQQ9 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
OTUD7BQ6GQQ9 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
OTUD7BQ6GQQ9 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
OTUD7BQ6GQQ9 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
OTUD7BQ6GQQ9 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
OTUD7BQ6GQQ9 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
OTUD7BQ6GQQ9 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms