Protein–RNA interactions for Protein: Q6F5E8

CARMIL2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL2Q6F5E8 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
CARMIL2Q6F5E8 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
CARMIL2Q6F5E8 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC36.83■■■■□ 3.49
CARMIL2Q6F5E8 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC36.83■■■■□ 3.49
CARMIL2Q6F5E8 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC36.83■■■■□ 3.49
CARMIL2Q6F5E8 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.82■■■■□ 3.49
CARMIL2Q6F5E8 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.49
CARMIL2Q6F5E8 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
CARMIL2Q6F5E8 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
CARMIL2Q6F5E8 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC36.82■■■■□ 3.48
CARMIL2Q6F5E8 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
CARMIL2Q6F5E8 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.81■■■■□ 3.48
CARMIL2Q6F5E8 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
CARMIL2Q6F5E8 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
CARMIL2Q6F5E8 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
CARMIL2Q6F5E8 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
CARMIL2Q6F5E8 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
CARMIL2Q6F5E8 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
CARMIL2Q6F5E8 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
CARMIL2Q6F5E8 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
CARMIL2Q6F5E8 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
CARMIL2Q6F5E8 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC36.79■■■■□ 3.48
CARMIL2Q6F5E8 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC36.79■■■■□ 3.48
CARMIL2Q6F5E8 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
CARMIL2Q6F5E8 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
CARMIL2Q6F5E8 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC36.78■■■■□ 3.48
CARMIL2Q6F5E8 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC36.78■■■■□ 3.48
CARMIL2Q6F5E8 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC36.78■■■■□ 3.48
CARMIL2Q6F5E8 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC36.78■■■■□ 3.48
CARMIL2Q6F5E8 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
CARMIL2Q6F5E8 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC36.78■■■■□ 3.48
CARMIL2Q6F5E8 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC36.78■■■■□ 3.48
CARMIL2Q6F5E8 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC36.78■■■■□ 3.48
CARMIL2Q6F5E8 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC36.77■■■■□ 3.48
CARMIL2Q6F5E8 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC36.77■■■■□ 3.48
CARMIL2Q6F5E8 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
CARMIL2Q6F5E8 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
CARMIL2Q6F5E8 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
CARMIL2Q6F5E8 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.76■■■■□ 3.48
CARMIL2Q6F5E8 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
CARMIL2Q6F5E8 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.76■■■■□ 3.47
CARMIL2Q6F5E8 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC36.76■■■■□ 3.47
CARMIL2Q6F5E8 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC36.76■■■■□ 3.47
CARMIL2Q6F5E8 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.76■■■■□ 3.47
CARMIL2Q6F5E8 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.75■■■■□ 3.47
CARMIL2Q6F5E8 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC36.74■■■■□ 3.47
CARMIL2Q6F5E8 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
CARMIL2Q6F5E8 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
CARMIL2Q6F5E8 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
CARMIL2Q6F5E8 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC36.74■■■■□ 3.47
CARMIL2Q6F5E8 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.74■■■■□ 3.47
CARMIL2Q6F5E8 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
CARMIL2Q6F5E8 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.73■■■■□ 3.47
CARMIL2Q6F5E8 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC36.73■■■■□ 3.47
CARMIL2Q6F5E8 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
CARMIL2Q6F5E8 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
CARMIL2Q6F5E8 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC36.73■■■■□ 3.47
CARMIL2Q6F5E8 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC36.73■■■■□ 3.47
CARMIL2Q6F5E8 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.72■■■■□ 3.47
CARMIL2Q6F5E8 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC36.71■■■■□ 3.47
CARMIL2Q6F5E8 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
CARMIL2Q6F5E8 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC36.71■■■■□ 3.47
CARMIL2Q6F5E8 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC36.71■■■■□ 3.47
CARMIL2Q6F5E8 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC36.71■■■■□ 3.47
CARMIL2Q6F5E8 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
CARMIL2Q6F5E8 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC36.71■■■■□ 3.47
CARMIL2Q6F5E8 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC36.7■■■■□ 3.47
CARMIL2Q6F5E8 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
CARMIL2Q6F5E8 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC36.7■■■■□ 3.47
CARMIL2Q6F5E8 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC36.7■■■■□ 3.47
CARMIL2Q6F5E8 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
CARMIL2Q6F5E8 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC36.7■■■■□ 3.47
CARMIL2Q6F5E8 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.69■■■■□ 3.46
CARMIL2Q6F5E8 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
CARMIL2Q6F5E8 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC36.69■■■■□ 3.46
CARMIL2Q6F5E8 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC36.69■■■■□ 3.46
CARMIL2Q6F5E8 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.69■■■■□ 3.46
CARMIL2Q6F5E8 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC36.69■■■■□ 3.46
CARMIL2Q6F5E8 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC36.69■■■■□ 3.46
CARMIL2Q6F5E8 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
CARMIL2Q6F5E8 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC36.69■■■■□ 3.46
CARMIL2Q6F5E8 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC36.69■■■■□ 3.46
CARMIL2Q6F5E8 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.69■■■■□ 3.46
CARMIL2Q6F5E8 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC36.69■■■■□ 3.46
CARMIL2Q6F5E8 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.68■■■■□ 3.46
CARMIL2Q6F5E8 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC36.68■■■■□ 3.46
CARMIL2Q6F5E8 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC36.68■■■■□ 3.46
CARMIL2Q6F5E8 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.68■■■■□ 3.46
CARMIL2Q6F5E8 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
CARMIL2Q6F5E8 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
CARMIL2Q6F5E8 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC36.68■■■■□ 3.46
CARMIL2Q6F5E8 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
CARMIL2Q6F5E8 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC36.67■■■■□ 3.46
CARMIL2Q6F5E8 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
CARMIL2Q6F5E8 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.67■■■■□ 3.46
CARMIL2Q6F5E8 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.67■■■■□ 3.46
CARMIL2Q6F5E8 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
CARMIL2Q6F5E8 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC36.67■■■■□ 3.46
CARMIL2Q6F5E8 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC36.67■■■■□ 3.46
CARMIL2Q6F5E8 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC36.67■■■■□ 3.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms