Protein–RNA interactions for Protein: Q69YH5

CDCA2, Cell division cycle-associated protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,023 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA2Q69YH5 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDCA2Q69YH5 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDCA2Q69YH5 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDCA2Q69YH5 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDCA2Q69YH5 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDCA2Q69YH5 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDCA2Q69YH5 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CDCA2Q69YH5 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDCA2Q69YH5 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDCA2Q69YH5 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDCA2Q69YH5 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDCA2Q69YH5 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDCA2Q69YH5 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDCA2Q69YH5 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDCA2Q69YH5 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDCA2Q69YH5 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDCA2Q69YH5 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDCA2Q69YH5 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDCA2Q69YH5 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDCA2Q69YH5 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDCA2Q69YH5 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDCA2Q69YH5 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDCA2Q69YH5 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDCA2Q69YH5 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDCA2Q69YH5 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDCA2Q69YH5 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDCA2Q69YH5 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDCA2Q69YH5 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDCA2Q69YH5 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDCA2Q69YH5 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDCA2Q69YH5 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDCA2Q69YH5 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDCA2Q69YH5 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDCA2Q69YH5 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CDCA2Q69YH5 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDCA2Q69YH5 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDCA2Q69YH5 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDCA2Q69YH5 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDCA2Q69YH5 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDCA2Q69YH5 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CDCA2Q69YH5 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CDCA2Q69YH5 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CDCA2Q69YH5 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CDCA2Q69YH5 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CDCA2Q69YH5 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CDCA2Q69YH5 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CDCA2Q69YH5 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CDCA2Q69YH5 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CDCA2Q69YH5 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CDCA2Q69YH5 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CDCA2Q69YH5 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CDCA2Q69YH5 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CDCA2Q69YH5 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CDCA2Q69YH5 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDCA2Q69YH5 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDCA2Q69YH5 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDCA2Q69YH5 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDCA2Q69YH5 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDCA2Q69YH5 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CDCA2Q69YH5 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDCA2Q69YH5 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDCA2Q69YH5 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDCA2Q69YH5 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDCA2Q69YH5 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDCA2Q69YH5 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDCA2Q69YH5 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDCA2Q69YH5 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDCA2Q69YH5 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDCA2Q69YH5 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDCA2Q69YH5 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDCA2Q69YH5 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDCA2Q69YH5 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDCA2Q69YH5 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDCA2Q69YH5 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDCA2Q69YH5 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDCA2Q69YH5 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDCA2Q69YH5 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDCA2Q69YH5 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDCA2Q69YH5 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDCA2Q69YH5 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDCA2Q69YH5 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDCA2Q69YH5 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CDCA2Q69YH5 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDCA2Q69YH5 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDCA2Q69YH5 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDCA2Q69YH5 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDCA2Q69YH5 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDCA2Q69YH5 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDCA2Q69YH5 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CDCA2Q69YH5 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDCA2Q69YH5 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDCA2Q69YH5 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDCA2Q69YH5 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDCA2Q69YH5 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDCA2Q69YH5 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDCA2Q69YH5 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CDCA2Q69YH5 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CDCA2Q69YH5 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDCA2Q69YH5 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDCA2Q69YH5 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.9 ms