Protein–RNA interactions for Protein: Q66K89

E4F1, Transcription factor E4F1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E4F1Q66K89 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
E4F1Q66K89 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
E4F1Q66K89 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
E4F1Q66K89 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
E4F1Q66K89 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
E4F1Q66K89 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
E4F1Q66K89 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
E4F1Q66K89 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
E4F1Q66K89 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
E4F1Q66K89 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
E4F1Q66K89 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
E4F1Q66K89 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
E4F1Q66K89 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
E4F1Q66K89 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
E4F1Q66K89 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
E4F1Q66K89 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
E4F1Q66K89 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
E4F1Q66K89 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
E4F1Q66K89 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
E4F1Q66K89 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
E4F1Q66K89 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
E4F1Q66K89 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
E4F1Q66K89 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
E4F1Q66K89 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
E4F1Q66K89 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
E4F1Q66K89 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
E4F1Q66K89 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
E4F1Q66K89 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
E4F1Q66K89 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
E4F1Q66K89 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
E4F1Q66K89 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
E4F1Q66K89 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
E4F1Q66K89 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
E4F1Q66K89 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
E4F1Q66K89 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
E4F1Q66K89 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
E4F1Q66K89 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.6
E4F1Q66K89 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
E4F1Q66K89 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
E4F1Q66K89 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
E4F1Q66K89 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
E4F1Q66K89 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
E4F1Q66K89 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
E4F1Q66K89 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
E4F1Q66K89 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
E4F1Q66K89 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
E4F1Q66K89 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
E4F1Q66K89 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
E4F1Q66K89 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
E4F1Q66K89 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
E4F1Q66K89 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
E4F1Q66K89 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
E4F1Q66K89 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
E4F1Q66K89 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
E4F1Q66K89 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25■■□□□ 1.59
E4F1Q66K89 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
E4F1Q66K89 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
E4F1Q66K89 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
E4F1Q66K89 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
E4F1Q66K89 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
E4F1Q66K89 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
E4F1Q66K89 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
E4F1Q66K89 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
E4F1Q66K89 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
E4F1Q66K89 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
E4F1Q66K89 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
E4F1Q66K89 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
E4F1Q66K89 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
E4F1Q66K89 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
E4F1Q66K89 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
E4F1Q66K89 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
E4F1Q66K89 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
E4F1Q66K89 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
E4F1Q66K89 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
E4F1Q66K89 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
E4F1Q66K89 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
E4F1Q66K89 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
E4F1Q66K89 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
E4F1Q66K89 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
E4F1Q66K89 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
E4F1Q66K89 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
E4F1Q66K89 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
E4F1Q66K89 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
E4F1Q66K89 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
E4F1Q66K89 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
E4F1Q66K89 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
E4F1Q66K89 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
E4F1Q66K89 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
E4F1Q66K89 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
E4F1Q66K89 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
E4F1Q66K89 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
E4F1Q66K89 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
E4F1Q66K89 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
E4F1Q66K89 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
E4F1Q66K89 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
E4F1Q66K89 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
E4F1Q66K89 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
E4F1Q66K89 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
E4F1Q66K89 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
E4F1Q66K89 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms