Protein–RNA interactions for Protein: Q60I27

ALS2CL, ALS2 C-terminal-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2CLQ60I27 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ALS2CLQ60I27 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ALS2CLQ60I27 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
ALS2CLQ60I27 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ALS2CLQ60I27 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ALS2CLQ60I27 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ALS2CLQ60I27 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ALS2CLQ60I27 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ALS2CLQ60I27 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ALS2CLQ60I27 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ALS2CLQ60I27 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ALS2CLQ60I27 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ALS2CLQ60I27 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ALS2CLQ60I27 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ALS2CLQ60I27 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ALS2CLQ60I27 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ALS2CLQ60I27 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ALS2CLQ60I27 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ALS2CLQ60I27 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ALS2CLQ60I27 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ALS2CLQ60I27 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ALS2CLQ60I27 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ALS2CLQ60I27 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ALS2CLQ60I27 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ALS2CLQ60I27 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ALS2CLQ60I27 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ALS2CLQ60I27 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ALS2CLQ60I27 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ALS2CLQ60I27 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ALS2CLQ60I27 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ALS2CLQ60I27 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ALS2CLQ60I27 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ALS2CLQ60I27 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ALS2CLQ60I27 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ALS2CLQ60I27 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ALS2CLQ60I27 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ALS2CLQ60I27 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ALS2CLQ60I27 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ALS2CLQ60I27 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ALS2CLQ60I27 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ALS2CLQ60I27 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ALS2CLQ60I27 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ALS2CLQ60I27 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ALS2CLQ60I27 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ALS2CLQ60I27 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ALS2CLQ60I27 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
ALS2CLQ60I27 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ALS2CLQ60I27 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ALS2CLQ60I27 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ALS2CLQ60I27 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ALS2CLQ60I27 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ALS2CLQ60I27 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ALS2CLQ60I27 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ALS2CLQ60I27 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ALS2CLQ60I27 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ALS2CLQ60I27 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ALS2CLQ60I27 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ALS2CLQ60I27 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ALS2CLQ60I27 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ALS2CLQ60I27 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ALS2CLQ60I27 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ALS2CLQ60I27 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ALS2CLQ60I27 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ALS2CLQ60I27 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ALS2CLQ60I27 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ALS2CLQ60I27 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ALS2CLQ60I27 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ALS2CLQ60I27 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ALS2CLQ60I27 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ALS2CLQ60I27 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ALS2CLQ60I27 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ALS2CLQ60I27 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ALS2CLQ60I27 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ALS2CLQ60I27 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ALS2CLQ60I27 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ALS2CLQ60I27 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ALS2CLQ60I27 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ALS2CLQ60I27 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ALS2CLQ60I27 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ALS2CLQ60I27 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ALS2CLQ60I27 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ALS2CLQ60I27 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ALS2CLQ60I27 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ALS2CLQ60I27 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ALS2CLQ60I27 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ALS2CLQ60I27 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
ALS2CLQ60I27 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
ALS2CLQ60I27 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
ALS2CLQ60I27 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ALS2CLQ60I27 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ALS2CLQ60I27 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ALS2CLQ60I27 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
ALS2CLQ60I27 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ALS2CLQ60I27 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ALS2CLQ60I27 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
ALS2CLQ60I27 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ALS2CLQ60I27 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
ALS2CLQ60I27 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ALS2CLQ60I27 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ALS2CLQ60I27 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms