Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI4

RNF123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, humanhuman

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF123Q5XPI4 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
RNF123Q5XPI4 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
RNF123Q5XPI4 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
RNF123Q5XPI4 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
RNF123Q5XPI4 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
RNF123Q5XPI4 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
RNF123Q5XPI4 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
RNF123Q5XPI4 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
RNF123Q5XPI4 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
RNF123Q5XPI4 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.42
RNF123Q5XPI4 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.42
RNF123Q5XPI4 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
RNF123Q5XPI4 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
RNF123Q5XPI4 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
RNF123Q5XPI4 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
RNF123Q5XPI4 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
RNF123Q5XPI4 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
RNF123Q5XPI4 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
RNF123Q5XPI4 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
RNF123Q5XPI4 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
RNF123Q5XPI4 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
RNF123Q5XPI4 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
RNF123Q5XPI4 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
RNF123Q5XPI4 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
RNF123Q5XPI4 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
RNF123Q5XPI4 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
RNF123Q5XPI4 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
RNF123Q5XPI4 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
RNF123Q5XPI4 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
RNF123Q5XPI4 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC30.17■■■□□ 2.42
RNF123Q5XPI4 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
RNF123Q5XPI4 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
RNF123Q5XPI4 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
RNF123Q5XPI4 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
RNF123Q5XPI4 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
RNF123Q5XPI4 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
RNF123Q5XPI4 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
RNF123Q5XPI4 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
RNF123Q5XPI4 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
RNF123Q5XPI4 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
RNF123Q5XPI4 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
RNF123Q5XPI4 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
RNF123Q5XPI4 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
RNF123Q5XPI4 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
RNF123Q5XPI4 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
RNF123Q5XPI4 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC30.15■■■□□ 2.42
RNF123Q5XPI4 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
RNF123Q5XPI4 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
RNF123Q5XPI4 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
RNF123Q5XPI4 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
RNF123Q5XPI4 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
RNF123Q5XPI4 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
RNF123Q5XPI4 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
RNF123Q5XPI4 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
RNF123Q5XPI4 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
RNF123Q5XPI4 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
RNF123Q5XPI4 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
RNF123Q5XPI4 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
RNF123Q5XPI4 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
RNF123Q5XPI4 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
RNF123Q5XPI4 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
RNF123Q5XPI4 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
RNF123Q5XPI4 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
RNF123Q5XPI4 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC30.12■■■□□ 2.41
RNF123Q5XPI4 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
RNF123Q5XPI4 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
RNF123Q5XPI4 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
RNF123Q5XPI4 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
RNF123Q5XPI4 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
RNF123Q5XPI4 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
RNF123Q5XPI4 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
RNF123Q5XPI4 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
RNF123Q5XPI4 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC30.11■■■□□ 2.41
RNF123Q5XPI4 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC30.11■■■□□ 2.41
RNF123Q5XPI4 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
RNF123Q5XPI4 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
RNF123Q5XPI4 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
RNF123Q5XPI4 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
RNF123Q5XPI4 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
RNF123Q5XPI4 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
RNF123Q5XPI4 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
RNF123Q5XPI4 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
RNF123Q5XPI4 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
RNF123Q5XPI4 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
RNF123Q5XPI4 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
RNF123Q5XPI4 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
RNF123Q5XPI4 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
RNF123Q5XPI4 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
RNF123Q5XPI4 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
RNF123Q5XPI4 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
RNF123Q5XPI4 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
RNF123Q5XPI4 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
RNF123Q5XPI4 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
RNF123Q5XPI4 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
RNF123Q5XPI4 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
RNF123Q5XPI4 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
RNF123Q5XPI4 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
RNF123Q5XPI4 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
RNF123Q5XPI4 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
RNF123Q5XPI4 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms