Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWN6

FAM208B, Protein FAM208B, humanhuman

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Length 2,430 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM208BQ5VWN6 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FAM208BQ5VWN6 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FAM208BQ5VWN6 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM208BQ5VWN6 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM208BQ5VWN6 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM208BQ5VWN6 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM208BQ5VWN6 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM208BQ5VWN6 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM208BQ5VWN6 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM208BQ5VWN6 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM208BQ5VWN6 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM208BQ5VWN6 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM208BQ5VWN6 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM208BQ5VWN6 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM208BQ5VWN6 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM208BQ5VWN6 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM208BQ5VWN6 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM208BQ5VWN6 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM208BQ5VWN6 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM208BQ5VWN6 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM208BQ5VWN6 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM208BQ5VWN6 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM208BQ5VWN6 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM208BQ5VWN6 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM208BQ5VWN6 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM208BQ5VWN6 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM208BQ5VWN6 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM208BQ5VWN6 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
FAM208BQ5VWN6 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FAM208BQ5VWN6 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FAM208BQ5VWN6 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FAM208BQ5VWN6 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
FAM208BQ5VWN6 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FAM208BQ5VWN6 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FAM208BQ5VWN6 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
FAM208BQ5VWN6 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FAM208BQ5VWN6 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FAM208BQ5VWN6 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FAM208BQ5VWN6 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FAM208BQ5VWN6 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FAM208BQ5VWN6 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FAM208BQ5VWN6 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FAM208BQ5VWN6 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FAM208BQ5VWN6 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FAM208BQ5VWN6 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FAM208BQ5VWN6 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAM208BQ5VWN6 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAM208BQ5VWN6 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAM208BQ5VWN6 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAM208BQ5VWN6 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAM208BQ5VWN6 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAM208BQ5VWN6 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAM208BQ5VWN6 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
FAM208BQ5VWN6 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAM208BQ5VWN6 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAM208BQ5VWN6 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAM208BQ5VWN6 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAM208BQ5VWN6 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAM208BQ5VWN6 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAM208BQ5VWN6 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAM208BQ5VWN6 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAM208BQ5VWN6 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAM208BQ5VWN6 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAM208BQ5VWN6 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAM208BQ5VWN6 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAM208BQ5VWN6 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAM208BQ5VWN6 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
FAM208BQ5VWN6 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FAM208BQ5VWN6 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
FAM208BQ5VWN6 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FAM208BQ5VWN6 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FAM208BQ5VWN6 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FAM208BQ5VWN6 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
FAM208BQ5VWN6 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FAM208BQ5VWN6 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FAM208BQ5VWN6 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FAM208BQ5VWN6 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
FAM208BQ5VWN6 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FAM208BQ5VWN6 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FAM208BQ5VWN6 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FAM208BQ5VWN6 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FAM208BQ5VWN6 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
FAM208BQ5VWN6 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
FAM208BQ5VWN6 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
FAM208BQ5VWN6 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FAM208BQ5VWN6 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FAM208BQ5VWN6 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
FAM208BQ5VWN6 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FAM208BQ5VWN6 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FAM208BQ5VWN6 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FAM208BQ5VWN6 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FAM208BQ5VWN6 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FAM208BQ5VWN6 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FAM208BQ5VWN6 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FAM208BQ5VWN6 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
FAM208BQ5VWN6 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
FAM208BQ5VWN6 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FAM208BQ5VWN6 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FAM208BQ5VWN6 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FAM208BQ5VWN6 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
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