Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWM6

PRAMEF13, Putative PRAME family member 13, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF13Q5VWM6 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRAMEF13Q5VWM6 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRAMEF13Q5VWM6 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRAMEF13Q5VWM6 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRAMEF13Q5VWM6 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRAMEF13Q5VWM6 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRAMEF13Q5VWM6 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRAMEF13Q5VWM6 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRAMEF13Q5VWM6 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PRAMEF13Q5VWM6 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRAMEF13Q5VWM6 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRAMEF13Q5VWM6 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRAMEF13Q5VWM6 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRAMEF13Q5VWM6 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRAMEF13Q5VWM6 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRAMEF13Q5VWM6 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRAMEF13Q5VWM6 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRAMEF13Q5VWM6 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRAMEF13Q5VWM6 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRAMEF13Q5VWM6 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRAMEF13Q5VWM6 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRAMEF13Q5VWM6 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRAMEF13Q5VWM6 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRAMEF13Q5VWM6 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRAMEF13Q5VWM6 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRAMEF13Q5VWM6 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRAMEF13Q5VWM6 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRAMEF13Q5VWM6 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRAMEF13Q5VWM6 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRAMEF13Q5VWM6 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRAMEF13Q5VWM6 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRAMEF13Q5VWM6 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRAMEF13Q5VWM6 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRAMEF13Q5VWM6 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRAMEF13Q5VWM6 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRAMEF13Q5VWM6 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRAMEF13Q5VWM6 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRAMEF13Q5VWM6 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PRAMEF13Q5VWM6 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRAMEF13Q5VWM6 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRAMEF13Q5VWM6 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRAMEF13Q5VWM6 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRAMEF13Q5VWM6 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRAMEF13Q5VWM6 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRAMEF13Q5VWM6 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRAMEF13Q5VWM6 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRAMEF13Q5VWM6 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRAMEF13Q5VWM6 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRAMEF13Q5VWM6 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRAMEF13Q5VWM6 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRAMEF13Q5VWM6 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRAMEF13Q5VWM6 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRAMEF13Q5VWM6 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRAMEF13Q5VWM6 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRAMEF13Q5VWM6 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRAMEF13Q5VWM6 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRAMEF13Q5VWM6 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRAMEF13Q5VWM6 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRAMEF13Q5VWM6 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRAMEF13Q5VWM6 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRAMEF13Q5VWM6 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRAMEF13Q5VWM6 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PRAMEF13Q5VWM6 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRAMEF13Q5VWM6 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRAMEF13Q5VWM6 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRAMEF13Q5VWM6 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRAMEF13Q5VWM6 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRAMEF13Q5VWM6 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRAMEF13Q5VWM6 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRAMEF13Q5VWM6 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRAMEF13Q5VWM6 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRAMEF13Q5VWM6 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRAMEF13Q5VWM6 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRAMEF13Q5VWM6 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRAMEF13Q5VWM6 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRAMEF13Q5VWM6 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRAMEF13Q5VWM6 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PRAMEF13Q5VWM6 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PRAMEF13Q5VWM6 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PRAMEF13Q5VWM6 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAMEF13Q5VWM6 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAMEF13Q5VWM6 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAMEF13Q5VWM6 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAMEF13Q5VWM6 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAMEF13Q5VWM6 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAMEF13Q5VWM6 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAMEF13Q5VWM6 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAMEF13Q5VWM6 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAMEF13Q5VWM6 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAMEF13Q5VWM6 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAMEF13Q5VWM6 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAMEF13Q5VWM6 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAMEF13Q5VWM6 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAMEF13Q5VWM6 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAMEF13Q5VWM6 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAMEF13Q5VWM6 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAMEF13Q5VWM6 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAMEF13Q5VWM6 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAMEF13Q5VWM6 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAMEF13Q5VWM6 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms