Protein–RNA interactions for Protein: Q5TDP6

LGSN, Lengsin, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGSNQ5TDP6 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LGSNQ5TDP6 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
LGSNQ5TDP6 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LGSNQ5TDP6 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23■■□□□ 1.27
LGSNQ5TDP6 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LGSNQ5TDP6 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LGSNQ5TDP6 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LGSNQ5TDP6 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LGSNQ5TDP6 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LGSNQ5TDP6 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LGSNQ5TDP6 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LGSNQ5TDP6 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LGSNQ5TDP6 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
LGSNQ5TDP6 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LGSNQ5TDP6 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LGSNQ5TDP6 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LGSNQ5TDP6 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LGSNQ5TDP6 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LGSNQ5TDP6 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LGSNQ5TDP6 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
LGSNQ5TDP6 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LGSNQ5TDP6 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LGSNQ5TDP6 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
LGSNQ5TDP6 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
LGSNQ5TDP6 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LGSNQ5TDP6 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LGSNQ5TDP6 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LGSNQ5TDP6 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LGSNQ5TDP6 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LGSNQ5TDP6 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LGSNQ5TDP6 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LGSNQ5TDP6 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LGSNQ5TDP6 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LGSNQ5TDP6 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LGSNQ5TDP6 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LGSNQ5TDP6 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LGSNQ5TDP6 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LGSNQ5TDP6 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LGSNQ5TDP6 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LGSNQ5TDP6 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LGSNQ5TDP6 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LGSNQ5TDP6 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
LGSNQ5TDP6 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LGSNQ5TDP6 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
LGSNQ5TDP6 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LGSNQ5TDP6 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LGSNQ5TDP6 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LGSNQ5TDP6 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LGSNQ5TDP6 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LGSNQ5TDP6 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LGSNQ5TDP6 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LGSNQ5TDP6 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LGSNQ5TDP6 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LGSNQ5TDP6 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LGSNQ5TDP6 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LGSNQ5TDP6 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LGSNQ5TDP6 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LGSNQ5TDP6 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LGSNQ5TDP6 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LGSNQ5TDP6 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LGSNQ5TDP6 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LGSNQ5TDP6 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LGSNQ5TDP6 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LGSNQ5TDP6 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LGSNQ5TDP6 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LGSNQ5TDP6 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LGSNQ5TDP6 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LGSNQ5TDP6 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LGSNQ5TDP6 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LGSNQ5TDP6 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LGSNQ5TDP6 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LGSNQ5TDP6 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LGSNQ5TDP6 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LGSNQ5TDP6 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LGSNQ5TDP6 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LGSNQ5TDP6 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LGSNQ5TDP6 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LGSNQ5TDP6 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LGSNQ5TDP6 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LGSNQ5TDP6 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LGSNQ5TDP6 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LGSNQ5TDP6 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LGSNQ5TDP6 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LGSNQ5TDP6 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LGSNQ5TDP6 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LGSNQ5TDP6 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LGSNQ5TDP6 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
LGSNQ5TDP6 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LGSNQ5TDP6 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LGSNQ5TDP6 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LGSNQ5TDP6 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LGSNQ5TDP6 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LGSNQ5TDP6 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LGSNQ5TDP6 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LGSNQ5TDP6 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LGSNQ5TDP6 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LGSNQ5TDP6 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LGSNQ5TDP6 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LGSNQ5TDP6 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LGSNQ5TDP6 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.5 ms