Protein–RNA interactions for Protein: Q5T7P8

SYT6, Synaptotagmin-6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 510 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT6Q5T7P8 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SYT6Q5T7P8 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SYT6Q5T7P8 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SYT6Q5T7P8 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SYT6Q5T7P8 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SYT6Q5T7P8 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SYT6Q5T7P8 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SYT6Q5T7P8 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SYT6Q5T7P8 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SYT6Q5T7P8 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SYT6Q5T7P8 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SYT6Q5T7P8 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SYT6Q5T7P8 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SYT6Q5T7P8 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SYT6Q5T7P8 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SYT6Q5T7P8 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SYT6Q5T7P8 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SYT6Q5T7P8 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SYT6Q5T7P8 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SYT6Q5T7P8 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SYT6Q5T7P8 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
SYT6Q5T7P8 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SYT6Q5T7P8 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SYT6Q5T7P8 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SYT6Q5T7P8 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
SYT6Q5T7P8 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
SYT6Q5T7P8 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
SYT6Q5T7P8 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SYT6Q5T7P8 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SYT6Q5T7P8 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SYT6Q5T7P8 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SYT6Q5T7P8 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
SYT6Q5T7P8 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SYT6Q5T7P8 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SYT6Q5T7P8 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SYT6Q5T7P8 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SYT6Q5T7P8 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SYT6Q5T7P8 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SYT6Q5T7P8 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SYT6Q5T7P8 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SYT6Q5T7P8 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SYT6Q5T7P8 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SYT6Q5T7P8 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SYT6Q5T7P8 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SYT6Q5T7P8 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SYT6Q5T7P8 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SYT6Q5T7P8 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SYT6Q5T7P8 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SYT6Q5T7P8 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SYT6Q5T7P8 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SYT6Q5T7P8 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SYT6Q5T7P8 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SYT6Q5T7P8 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SYT6Q5T7P8 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SYT6Q5T7P8 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SYT6Q5T7P8 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SYT6Q5T7P8 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SYT6Q5T7P8 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
SYT6Q5T7P8 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SYT6Q5T7P8 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SYT6Q5T7P8 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SYT6Q5T7P8 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SYT6Q5T7P8 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SYT6Q5T7P8 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
SYT6Q5T7P8 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SYT6Q5T7P8 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SYT6Q5T7P8 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SYT6Q5T7P8 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SYT6Q5T7P8 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SYT6Q5T7P8 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SYT6Q5T7P8 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SYT6Q5T7P8 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SYT6Q5T7P8 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SYT6Q5T7P8 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SYT6Q5T7P8 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SYT6Q5T7P8 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SYT6Q5T7P8 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SYT6Q5T7P8 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SYT6Q5T7P8 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SYT6Q5T7P8 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SYT6Q5T7P8 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SYT6Q5T7P8 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SYT6Q5T7P8 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SYT6Q5T7P8 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SYT6Q5T7P8 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SYT6Q5T7P8 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SYT6Q5T7P8 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SYT6Q5T7P8 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SYT6Q5T7P8 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SYT6Q5T7P8 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SYT6Q5T7P8 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SYT6Q5T7P8 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SYT6Q5T7P8 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SYT6Q5T7P8 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SYT6Q5T7P8 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SYT6Q5T7P8 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SYT6Q5T7P8 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SYT6Q5T7P8 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SYT6Q5T7P8 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SYT6Q5T7P8 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms