Protein–RNA interactions for Protein: Q5T7N2

L1TD1, LINE-1 type transposase domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 865 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1TD1Q5T7N2 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
L1TD1Q5T7N2 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
L1TD1Q5T7N2 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
L1TD1Q5T7N2 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
L1TD1Q5T7N2 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.88
L1TD1Q5T7N2 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
L1TD1Q5T7N2 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
L1TD1Q5T7N2 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
L1TD1Q5T7N2 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
L1TD1Q5T7N2 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
L1TD1Q5T7N2 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
L1TD1Q5T7N2 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
L1TD1Q5T7N2 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
L1TD1Q5T7N2 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
L1TD1Q5T7N2 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
L1TD1Q5T7N2 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
L1TD1Q5T7N2 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
L1TD1Q5T7N2 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
L1TD1Q5T7N2 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
L1TD1Q5T7N2 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
L1TD1Q5T7N2 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
L1TD1Q5T7N2 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
L1TD1Q5T7N2 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
L1TD1Q5T7N2 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
L1TD1Q5T7N2 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
L1TD1Q5T7N2 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
L1TD1Q5T7N2 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
L1TD1Q5T7N2 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
L1TD1Q5T7N2 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
L1TD1Q5T7N2 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
L1TD1Q5T7N2 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
L1TD1Q5T7N2 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
L1TD1Q5T7N2 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
L1TD1Q5T7N2 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
L1TD1Q5T7N2 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
L1TD1Q5T7N2 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
L1TD1Q5T7N2 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
L1TD1Q5T7N2 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
L1TD1Q5T7N2 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
L1TD1Q5T7N2 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
L1TD1Q5T7N2 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
L1TD1Q5T7N2 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
L1TD1Q5T7N2 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
L1TD1Q5T7N2 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
L1TD1Q5T7N2 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
L1TD1Q5T7N2 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
L1TD1Q5T7N2 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
L1TD1Q5T7N2 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
L1TD1Q5T7N2 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
L1TD1Q5T7N2 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
L1TD1Q5T7N2 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
L1TD1Q5T7N2 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
L1TD1Q5T7N2 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
L1TD1Q5T7N2 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
L1TD1Q5T7N2 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
L1TD1Q5T7N2 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
L1TD1Q5T7N2 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
L1TD1Q5T7N2 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
L1TD1Q5T7N2 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
L1TD1Q5T7N2 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
L1TD1Q5T7N2 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
L1TD1Q5T7N2 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
L1TD1Q5T7N2 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
L1TD1Q5T7N2 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
L1TD1Q5T7N2 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
L1TD1Q5T7N2 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
L1TD1Q5T7N2 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
L1TD1Q5T7N2 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
L1TD1Q5T7N2 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
L1TD1Q5T7N2 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
L1TD1Q5T7N2 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
L1TD1Q5T7N2 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
L1TD1Q5T7N2 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
L1TD1Q5T7N2 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
L1TD1Q5T7N2 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
L1TD1Q5T7N2 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
L1TD1Q5T7N2 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
L1TD1Q5T7N2 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
L1TD1Q5T7N2 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
L1TD1Q5T7N2 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
L1TD1Q5T7N2 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
L1TD1Q5T7N2 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
L1TD1Q5T7N2 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
L1TD1Q5T7N2 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
L1TD1Q5T7N2 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
L1TD1Q5T7N2 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
L1TD1Q5T7N2 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
L1TD1Q5T7N2 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
L1TD1Q5T7N2 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
L1TD1Q5T7N2 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
L1TD1Q5T7N2 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
L1TD1Q5T7N2 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
L1TD1Q5T7N2 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
L1TD1Q5T7N2 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
L1TD1Q5T7N2 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
L1TD1Q5T7N2 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
L1TD1Q5T7N2 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
L1TD1Q5T7N2 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
L1TD1Q5T7N2 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
L1TD1Q5T7N2 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms