Protein–RNA interactions for Protein: Q5T3J3

LRIF1, Ligand-dependent nuclear receptor-interacting factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIF1Q5T3J3 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRIF1Q5T3J3 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
LRIF1Q5T3J3 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRIF1Q5T3J3 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRIF1Q5T3J3 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRIF1Q5T3J3 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRIF1Q5T3J3 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRIF1Q5T3J3 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRIF1Q5T3J3 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRIF1Q5T3J3 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
LRIF1Q5T3J3 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRIF1Q5T3J3 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRIF1Q5T3J3 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRIF1Q5T3J3 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRIF1Q5T3J3 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRIF1Q5T3J3 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRIF1Q5T3J3 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRIF1Q5T3J3 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRIF1Q5T3J3 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRIF1Q5T3J3 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRIF1Q5T3J3 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRIF1Q5T3J3 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRIF1Q5T3J3 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRIF1Q5T3J3 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRIF1Q5T3J3 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRIF1Q5T3J3 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRIF1Q5T3J3 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
LRIF1Q5T3J3 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRIF1Q5T3J3 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRIF1Q5T3J3 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRIF1Q5T3J3 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRIF1Q5T3J3 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRIF1Q5T3J3 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRIF1Q5T3J3 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRIF1Q5T3J3 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRIF1Q5T3J3 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRIF1Q5T3J3 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRIF1Q5T3J3 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRIF1Q5T3J3 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRIF1Q5T3J3 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRIF1Q5T3J3 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
LRIF1Q5T3J3 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRIF1Q5T3J3 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRIF1Q5T3J3 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRIF1Q5T3J3 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRIF1Q5T3J3 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRIF1Q5T3J3 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LRIF1Q5T3J3 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
LRIF1Q5T3J3 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LRIF1Q5T3J3 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LRIF1Q5T3J3 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRIF1Q5T3J3 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRIF1Q5T3J3 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRIF1Q5T3J3 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRIF1Q5T3J3 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRIF1Q5T3J3 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRIF1Q5T3J3 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
LRIF1Q5T3J3 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
LRIF1Q5T3J3 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRIF1Q5T3J3 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRIF1Q5T3J3 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRIF1Q5T3J3 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRIF1Q5T3J3 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRIF1Q5T3J3 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRIF1Q5T3J3 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRIF1Q5T3J3 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRIF1Q5T3J3 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRIF1Q5T3J3 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRIF1Q5T3J3 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRIF1Q5T3J3 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRIF1Q5T3J3 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRIF1Q5T3J3 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRIF1Q5T3J3 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRIF1Q5T3J3 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRIF1Q5T3J3 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRIF1Q5T3J3 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRIF1Q5T3J3 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRIF1Q5T3J3 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
LRIF1Q5T3J3 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRIF1Q5T3J3 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRIF1Q5T3J3 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRIF1Q5T3J3 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRIF1Q5T3J3 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRIF1Q5T3J3 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRIF1Q5T3J3 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRIF1Q5T3J3 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRIF1Q5T3J3 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRIF1Q5T3J3 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRIF1Q5T3J3 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRIF1Q5T3J3 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRIF1Q5T3J3 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRIF1Q5T3J3 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRIF1Q5T3J3 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRIF1Q5T3J3 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
LRIF1Q5T3J3 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRIF1Q5T3J3 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRIF1Q5T3J3 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRIF1Q5T3J3 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRIF1Q5T3J3 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRIF1Q5T3J3 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms