Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0U0

CCDC122, Coiled-coil domain-containing protein 122, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC122Q5T0U0 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC122Q5T0U0 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC122Q5T0U0 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC122Q5T0U0 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC122Q5T0U0 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC122Q5T0U0 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC122Q5T0U0 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC122Q5T0U0 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC122Q5T0U0 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC122Q5T0U0 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC122Q5T0U0 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC122Q5T0U0 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC122Q5T0U0 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC122Q5T0U0 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC122Q5T0U0 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC122Q5T0U0 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC122Q5T0U0 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC122Q5T0U0 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC122Q5T0U0 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC122Q5T0U0 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC122Q5T0U0 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC122Q5T0U0 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC122Q5T0U0 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC122Q5T0U0 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC122Q5T0U0 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC122Q5T0U0 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC122Q5T0U0 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC122Q5T0U0 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC122Q5T0U0 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC122Q5T0U0 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC122Q5T0U0 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC122Q5T0U0 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC122Q5T0U0 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC122Q5T0U0 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC122Q5T0U0 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC122Q5T0U0 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC122Q5T0U0 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC122Q5T0U0 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC122Q5T0U0 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC122Q5T0U0 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC122Q5T0U0 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC122Q5T0U0 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC122Q5T0U0 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC122Q5T0U0 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC122Q5T0U0 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC122Q5T0U0 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC122Q5T0U0 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC122Q5T0U0 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC122Q5T0U0 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC122Q5T0U0 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC122Q5T0U0 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC122Q5T0U0 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC122Q5T0U0 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC122Q5T0U0 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC122Q5T0U0 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC122Q5T0U0 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC122Q5T0U0 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC122Q5T0U0 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC122Q5T0U0 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC122Q5T0U0 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC122Q5T0U0 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC122Q5T0U0 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC122Q5T0U0 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC122Q5T0U0 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC122Q5T0U0 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC122Q5T0U0 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC122Q5T0U0 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC122Q5T0U0 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC122Q5T0U0 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC122Q5T0U0 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC122Q5T0U0 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC122Q5T0U0 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC122Q5T0U0 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC122Q5T0U0 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC122Q5T0U0 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC122Q5T0U0 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC122Q5T0U0 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC122Q5T0U0 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC122Q5T0U0 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC122Q5T0U0 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC122Q5T0U0 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CCDC122Q5T0U0 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CCDC122Q5T0U0 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
CCDC122Q5T0U0 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC122Q5T0U0 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC122Q5T0U0 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC122Q5T0U0 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC122Q5T0U0 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC122Q5T0U0 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC122Q5T0U0 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC122Q5T0U0 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC122Q5T0U0 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC122Q5T0U0 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC122Q5T0U0 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC122Q5T0U0 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC122Q5T0U0 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC122Q5T0U0 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC122Q5T0U0 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC122Q5T0U0 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC122Q5T0U0 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms