Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV17

TMEM240, Transmembrane protein 240, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM240Q5SV17 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMEM240Q5SV17 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMEM240Q5SV17 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMEM240Q5SV17 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMEM240Q5SV17 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMEM240Q5SV17 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMEM240Q5SV17 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMEM240Q5SV17 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMEM240Q5SV17 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMEM240Q5SV17 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMEM240Q5SV17 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMEM240Q5SV17 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMEM240Q5SV17 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMEM240Q5SV17 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM240Q5SV17 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM240Q5SV17 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM240Q5SV17 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM240Q5SV17 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM240Q5SV17 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM240Q5SV17 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM240Q5SV17 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM240Q5SV17 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM240Q5SV17 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM240Q5SV17 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM240Q5SV17 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM240Q5SV17 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM240Q5SV17 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM240Q5SV17 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TMEM240Q5SV17 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMEM240Q5SV17 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMEM240Q5SV17 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMEM240Q5SV17 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMEM240Q5SV17 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMEM240Q5SV17 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMEM240Q5SV17 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMEM240Q5SV17 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMEM240Q5SV17 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMEM240Q5SV17 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
TMEM240Q5SV17 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMEM240Q5SV17 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMEM240Q5SV17 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMEM240Q5SV17 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM240Q5SV17 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM240Q5SV17 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM240Q5SV17 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM240Q5SV17 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMEM240Q5SV17 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMEM240Q5SV17 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMEM240Q5SV17 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
TMEM240Q5SV17 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMEM240Q5SV17 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMEM240Q5SV17 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
TMEM240Q5SV17 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMEM240Q5SV17 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMEM240Q5SV17 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMEM240Q5SV17 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMEM240Q5SV17 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMEM240Q5SV17 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
TMEM240Q5SV17 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMEM240Q5SV17 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMEM240Q5SV17 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMEM240Q5SV17 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMEM240Q5SV17 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMEM240Q5SV17 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMEM240Q5SV17 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMEM240Q5SV17 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMEM240Q5SV17 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMEM240Q5SV17 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMEM240Q5SV17 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMEM240Q5SV17 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMEM240Q5SV17 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMEM240Q5SV17 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMEM240Q5SV17 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMEM240Q5SV17 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMEM240Q5SV17 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMEM240Q5SV17 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMEM240Q5SV17 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
TMEM240Q5SV17 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMEM240Q5SV17 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMEM240Q5SV17 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMEM240Q5SV17 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMEM240Q5SV17 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMEM240Q5SV17 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMEM240Q5SV17 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMEM240Q5SV17 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMEM240Q5SV17 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TMEM240Q5SV17 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TMEM240Q5SV17 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TMEM240Q5SV17 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMEM240Q5SV17 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMEM240Q5SV17 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMEM240Q5SV17 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMEM240Q5SV17 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMEM240Q5SV17 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMEM240Q5SV17 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMEM240Q5SV17 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMEM240Q5SV17 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMEM240Q5SV17 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMEM240Q5SV17 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMEM240Q5SV17 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms