Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVL4

EFHC1, EF-hand domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHC1Q5JVL4 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EFHC1Q5JVL4 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EFHC1Q5JVL4 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EFHC1Q5JVL4 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EFHC1Q5JVL4 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EFHC1Q5JVL4 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EFHC1Q5JVL4 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EFHC1Q5JVL4 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EFHC1Q5JVL4 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EFHC1Q5JVL4 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EFHC1Q5JVL4 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EFHC1Q5JVL4 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EFHC1Q5JVL4 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EFHC1Q5JVL4 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EFHC1Q5JVL4 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EFHC1Q5JVL4 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EFHC1Q5JVL4 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EFHC1Q5JVL4 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EFHC1Q5JVL4 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EFHC1Q5JVL4 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EFHC1Q5JVL4 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EFHC1Q5JVL4 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
EFHC1Q5JVL4 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
EFHC1Q5JVL4 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
EFHC1Q5JVL4 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EFHC1Q5JVL4 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
EFHC1Q5JVL4 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
EFHC1Q5JVL4 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EFHC1Q5JVL4 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
EFHC1Q5JVL4 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
EFHC1Q5JVL4 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
EFHC1Q5JVL4 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
EFHC1Q5JVL4 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EFHC1Q5JVL4 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EFHC1Q5JVL4 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
EFHC1Q5JVL4 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
EFHC1Q5JVL4 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
EFHC1Q5JVL4 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
EFHC1Q5JVL4 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EFHC1Q5JVL4 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
EFHC1Q5JVL4 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
EFHC1Q5JVL4 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EFHC1Q5JVL4 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EFHC1Q5JVL4 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EFHC1Q5JVL4 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EFHC1Q5JVL4 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
EFHC1Q5JVL4 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
EFHC1Q5JVL4 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
EFHC1Q5JVL4 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EFHC1Q5JVL4 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
EFHC1Q5JVL4 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EFHC1Q5JVL4 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EFHC1Q5JVL4 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
EFHC1Q5JVL4 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
EFHC1Q5JVL4 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
EFHC1Q5JVL4 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
EFHC1Q5JVL4 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
EFHC1Q5JVL4 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
EFHC1Q5JVL4 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
EFHC1Q5JVL4 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
EFHC1Q5JVL4 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
EFHC1Q5JVL4 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EFHC1Q5JVL4 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EFHC1Q5JVL4 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
EFHC1Q5JVL4 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EFHC1Q5JVL4 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
EFHC1Q5JVL4 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
EFHC1Q5JVL4 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
EFHC1Q5JVL4 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EFHC1Q5JVL4 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
EFHC1Q5JVL4 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
EFHC1Q5JVL4 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EFHC1Q5JVL4 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EFHC1Q5JVL4 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EFHC1Q5JVL4 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EFHC1Q5JVL4 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EFHC1Q5JVL4 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
EFHC1Q5JVL4 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
EFHC1Q5JVL4 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EFHC1Q5JVL4 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
EFHC1Q5JVL4 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EFHC1Q5JVL4 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EFHC1Q5JVL4 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EFHC1Q5JVL4 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EFHC1Q5JVL4 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EFHC1Q5JVL4 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EFHC1Q5JVL4 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EFHC1Q5JVL4 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EFHC1Q5JVL4 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EFHC1Q5JVL4 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EFHC1Q5JVL4 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EFHC1Q5JVL4 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
EFHC1Q5JVL4 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EFHC1Q5JVL4 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EFHC1Q5JVL4 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EFHC1Q5JVL4 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EFHC1Q5JVL4 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EFHC1Q5JVL4 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EFHC1Q5JVL4 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EFHC1Q5JVL4 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms