Protein–RNA interactions for Protein: Q5JSH3

WDR44, WD repeat-containing protein 44, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR44Q5JSH3 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
WDR44Q5JSH3 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
WDR44Q5JSH3 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
WDR44Q5JSH3 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
WDR44Q5JSH3 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
WDR44Q5JSH3 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
WDR44Q5JSH3 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
WDR44Q5JSH3 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
WDR44Q5JSH3 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
WDR44Q5JSH3 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
WDR44Q5JSH3 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
WDR44Q5JSH3 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
WDR44Q5JSH3 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
WDR44Q5JSH3 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
WDR44Q5JSH3 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
WDR44Q5JSH3 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
WDR44Q5JSH3 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
WDR44Q5JSH3 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
WDR44Q5JSH3 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
WDR44Q5JSH3 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
WDR44Q5JSH3 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
WDR44Q5JSH3 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
WDR44Q5JSH3 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
WDR44Q5JSH3 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
WDR44Q5JSH3 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
WDR44Q5JSH3 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
WDR44Q5JSH3 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
WDR44Q5JSH3 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
WDR44Q5JSH3 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
WDR44Q5JSH3 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
WDR44Q5JSH3 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
WDR44Q5JSH3 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
WDR44Q5JSH3 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
WDR44Q5JSH3 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
WDR44Q5JSH3 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
WDR44Q5JSH3 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
WDR44Q5JSH3 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
WDR44Q5JSH3 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
WDR44Q5JSH3 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
WDR44Q5JSH3 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
WDR44Q5JSH3 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
WDR44Q5JSH3 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
WDR44Q5JSH3 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
WDR44Q5JSH3 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
WDR44Q5JSH3 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
WDR44Q5JSH3 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
WDR44Q5JSH3 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
WDR44Q5JSH3 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
WDR44Q5JSH3 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
WDR44Q5JSH3 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
WDR44Q5JSH3 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
WDR44Q5JSH3 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
WDR44Q5JSH3 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
WDR44Q5JSH3 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
WDR44Q5JSH3 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
WDR44Q5JSH3 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
WDR44Q5JSH3 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
WDR44Q5JSH3 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
WDR44Q5JSH3 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
WDR44Q5JSH3 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
WDR44Q5JSH3 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
WDR44Q5JSH3 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
WDR44Q5JSH3 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
WDR44Q5JSH3 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
WDR44Q5JSH3 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
WDR44Q5JSH3 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
WDR44Q5JSH3 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
WDR44Q5JSH3 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
WDR44Q5JSH3 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
WDR44Q5JSH3 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
WDR44Q5JSH3 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
WDR44Q5JSH3 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
WDR44Q5JSH3 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
WDR44Q5JSH3 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
WDR44Q5JSH3 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
WDR44Q5JSH3 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
WDR44Q5JSH3 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
WDR44Q5JSH3 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
WDR44Q5JSH3 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
WDR44Q5JSH3 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
WDR44Q5JSH3 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
WDR44Q5JSH3 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
WDR44Q5JSH3 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
WDR44Q5JSH3 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
WDR44Q5JSH3 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
WDR44Q5JSH3 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
WDR44Q5JSH3 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
WDR44Q5JSH3 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
WDR44Q5JSH3 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
WDR44Q5JSH3 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
WDR44Q5JSH3 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
WDR44Q5JSH3 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
WDR44Q5JSH3 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
WDR44Q5JSH3 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
WDR44Q5JSH3 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
WDR44Q5JSH3 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
WDR44Q5JSH3 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
WDR44Q5JSH3 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
WDR44Q5JSH3 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
WDR44Q5JSH3 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms