Protein–RNA interactions for Protein: Q5FWF7

FBXO48, F-box only protein 48, humanhuman

Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO48Q5FWF7 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
FBXO48Q5FWF7 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FBXO48Q5FWF7 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FBXO48Q5FWF7 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FBXO48Q5FWF7 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FBXO48Q5FWF7 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FBXO48Q5FWF7 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FBXO48Q5FWF7 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FBXO48Q5FWF7 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FBXO48Q5FWF7 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FBXO48Q5FWF7 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FBXO48Q5FWF7 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FBXO48Q5FWF7 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FBXO48Q5FWF7 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
FBXO48Q5FWF7 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
FBXO48Q5FWF7 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FBXO48Q5FWF7 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FBXO48Q5FWF7 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FBXO48Q5FWF7 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
FBXO48Q5FWF7 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
FBXO48Q5FWF7 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FBXO48Q5FWF7 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FBXO48Q5FWF7 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FBXO48Q5FWF7 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FBXO48Q5FWF7 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FBXO48Q5FWF7 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FBXO48Q5FWF7 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FBXO48Q5FWF7 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FBXO48Q5FWF7 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FBXO48Q5FWF7 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
FBXO48Q5FWF7 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FBXO48Q5FWF7 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FBXO48Q5FWF7 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FBXO48Q5FWF7 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FBXO48Q5FWF7 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FBXO48Q5FWF7 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FBXO48Q5FWF7 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FBXO48Q5FWF7 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FBXO48Q5FWF7 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FBXO48Q5FWF7 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FBXO48Q5FWF7 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FBXO48Q5FWF7 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FBXO48Q5FWF7 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FBXO48Q5FWF7 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FBXO48Q5FWF7 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FBXO48Q5FWF7 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FBXO48Q5FWF7 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
FBXO48Q5FWF7 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FBXO48Q5FWF7 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FBXO48Q5FWF7 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FBXO48Q5FWF7 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FBXO48Q5FWF7 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FBXO48Q5FWF7 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FBXO48Q5FWF7 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FBXO48Q5FWF7 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FBXO48Q5FWF7 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FBXO48Q5FWF7 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FBXO48Q5FWF7 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FBXO48Q5FWF7 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FBXO48Q5FWF7 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FBXO48Q5FWF7 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
FBXO48Q5FWF7 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
FBXO48Q5FWF7 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FBXO48Q5FWF7 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FBXO48Q5FWF7 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FBXO48Q5FWF7 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FBXO48Q5FWF7 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FBXO48Q5FWF7 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FBXO48Q5FWF7 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FBXO48Q5FWF7 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
FBXO48Q5FWF7 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FBXO48Q5FWF7 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FBXO48Q5FWF7 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
FBXO48Q5FWF7 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FBXO48Q5FWF7 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
FBXO48Q5FWF7 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FBXO48Q5FWF7 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FBXO48Q5FWF7 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FBXO48Q5FWF7 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FBXO48Q5FWF7 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FBXO48Q5FWF7 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FBXO48Q5FWF7 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FBXO48Q5FWF7 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FBXO48Q5FWF7 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FBXO48Q5FWF7 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
FBXO48Q5FWF7 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
FBXO48Q5FWF7 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
FBXO48Q5FWF7 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FBXO48Q5FWF7 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
FBXO48Q5FWF7 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FBXO48Q5FWF7 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FBXO48Q5FWF7 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FBXO48Q5FWF7 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FBXO48Q5FWF7 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FBXO48Q5FWF7 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FBXO48Q5FWF7 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FBXO48Q5FWF7 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FBXO48Q5FWF7 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FBXO48Q5FWF7 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FBXO48Q5FWF7 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms