Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBM4

ZNF542P, Putative zinc finger protein 542, humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF542PQ5EBM4 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF542PQ5EBM4 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF542PQ5EBM4 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF542PQ5EBM4 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF542PQ5EBM4 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF542PQ5EBM4 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF542PQ5EBM4 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF542PQ5EBM4 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF542PQ5EBM4 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF542PQ5EBM4 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF542PQ5EBM4 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF542PQ5EBM4 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
ZNF542PQ5EBM4 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF542PQ5EBM4 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF542PQ5EBM4 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF542PQ5EBM4 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF542PQ5EBM4 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF542PQ5EBM4 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF542PQ5EBM4 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF542PQ5EBM4 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF542PQ5EBM4 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF542PQ5EBM4 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF542PQ5EBM4 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF542PQ5EBM4 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF542PQ5EBM4 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF542PQ5EBM4 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF542PQ5EBM4 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF542PQ5EBM4 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF542PQ5EBM4 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF542PQ5EBM4 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF542PQ5EBM4 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF542PQ5EBM4 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF542PQ5EBM4 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF542PQ5EBM4 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF542PQ5EBM4 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF542PQ5EBM4 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF542PQ5EBM4 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF542PQ5EBM4 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF542PQ5EBM4 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF542PQ5EBM4 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF542PQ5EBM4 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF542PQ5EBM4 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF542PQ5EBM4 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF542PQ5EBM4 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF542PQ5EBM4 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF542PQ5EBM4 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF542PQ5EBM4 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF542PQ5EBM4 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF542PQ5EBM4 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF542PQ5EBM4 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF542PQ5EBM4 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF542PQ5EBM4 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF542PQ5EBM4 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF542PQ5EBM4 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF542PQ5EBM4 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF542PQ5EBM4 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF542PQ5EBM4 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF542PQ5EBM4 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF542PQ5EBM4 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF542PQ5EBM4 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF542PQ5EBM4 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF542PQ5EBM4 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF542PQ5EBM4 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF542PQ5EBM4 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF542PQ5EBM4 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF542PQ5EBM4 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF542PQ5EBM4 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF542PQ5EBM4 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF542PQ5EBM4 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF542PQ5EBM4 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF542PQ5EBM4 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF542PQ5EBM4 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF542PQ5EBM4 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF542PQ5EBM4 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ZNF542PQ5EBM4 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF542PQ5EBM4 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF542PQ5EBM4 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF542PQ5EBM4 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF542PQ5EBM4 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF542PQ5EBM4 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF542PQ5EBM4 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF542PQ5EBM4 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF542PQ5EBM4 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF542PQ5EBM4 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF542PQ5EBM4 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF542PQ5EBM4 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF542PQ5EBM4 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF542PQ5EBM4 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF542PQ5EBM4 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF542PQ5EBM4 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF542PQ5EBM4 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF542PQ5EBM4 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF542PQ5EBM4 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF542PQ5EBM4 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF542PQ5EBM4 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF542PQ5EBM4 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF542PQ5EBM4 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF542PQ5EBM4 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF542PQ5EBM4 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF542PQ5EBM4 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.6 ms