Protein–RNA interactions for Protein: Q587I9

SFT2D3, Vesicle transport protein SFT2C, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D3Q587I9 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SFT2D3Q587I9 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SFT2D3Q587I9 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SFT2D3Q587I9 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SFT2D3Q587I9 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SFT2D3Q587I9 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SFT2D3Q587I9 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SFT2D3Q587I9 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SFT2D3Q587I9 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SFT2D3Q587I9 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SFT2D3Q587I9 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SFT2D3Q587I9 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SFT2D3Q587I9 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SFT2D3Q587I9 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SFT2D3Q587I9 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SFT2D3Q587I9 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SFT2D3Q587I9 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SFT2D3Q587I9 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SFT2D3Q587I9 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SFT2D3Q587I9 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SFT2D3Q587I9 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SFT2D3Q587I9 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SFT2D3Q587I9 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SFT2D3Q587I9 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SFT2D3Q587I9 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SFT2D3Q587I9 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SFT2D3Q587I9 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SFT2D3Q587I9 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SFT2D3Q587I9 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SFT2D3Q587I9 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SFT2D3Q587I9 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SFT2D3Q587I9 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SFT2D3Q587I9 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SFT2D3Q587I9 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SFT2D3Q587I9 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SFT2D3Q587I9 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SFT2D3Q587I9 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SFT2D3Q587I9 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SFT2D3Q587I9 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SFT2D3Q587I9 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SFT2D3Q587I9 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SFT2D3Q587I9 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SFT2D3Q587I9 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SFT2D3Q587I9 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SFT2D3Q587I9 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SFT2D3Q587I9 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SFT2D3Q587I9 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SFT2D3Q587I9 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SFT2D3Q587I9 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SFT2D3Q587I9 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SFT2D3Q587I9 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SFT2D3Q587I9 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SFT2D3Q587I9 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SFT2D3Q587I9 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SFT2D3Q587I9 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SFT2D3Q587I9 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SFT2D3Q587I9 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SFT2D3Q587I9 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SFT2D3Q587I9 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SFT2D3Q587I9 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SFT2D3Q587I9 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SFT2D3Q587I9 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SFT2D3Q587I9 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SFT2D3Q587I9 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SFT2D3Q587I9 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SFT2D3Q587I9 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SFT2D3Q587I9 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SFT2D3Q587I9 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SFT2D3Q587I9 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SFT2D3Q587I9 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SFT2D3Q587I9 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
SFT2D3Q587I9 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SFT2D3Q587I9 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SFT2D3Q587I9 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SFT2D3Q587I9 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SFT2D3Q587I9 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SFT2D3Q587I9 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SFT2D3Q587I9 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SFT2D3Q587I9 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SFT2D3Q587I9 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SFT2D3Q587I9 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SFT2D3Q587I9 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SFT2D3Q587I9 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SFT2D3Q587I9 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SFT2D3Q587I9 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SFT2D3Q587I9 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SFT2D3Q587I9 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SFT2D3Q587I9 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SFT2D3Q587I9 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SFT2D3Q587I9 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SFT2D3Q587I9 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SFT2D3Q587I9 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SFT2D3Q587I9 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SFT2D3Q587I9 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SFT2D3Q587I9 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SFT2D3Q587I9 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SFT2D3Q587I9 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SFT2D3Q587I9 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SFT2D3Q587I9 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SFT2D3Q587I9 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.5 ms