Protein–RNA interactions for Protein: Q56UQ5

TPT1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q56UQ5 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q56UQ5 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q56UQ5 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q56UQ5 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q56UQ5 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q56UQ5 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q56UQ5 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q56UQ5 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q56UQ5 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q56UQ5 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q56UQ5 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Q56UQ5 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Q56UQ5 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q56UQ5 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q56UQ5 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q56UQ5 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q56UQ5 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q56UQ5 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Q56UQ5 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q56UQ5 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Q56UQ5 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q56UQ5 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q56UQ5 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q56UQ5 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q56UQ5 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q56UQ5 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q56UQ5 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q56UQ5 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q56UQ5 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q56UQ5 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q56UQ5 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q56UQ5 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q56UQ5 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q56UQ5 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q56UQ5 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q56UQ5 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q56UQ5 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q56UQ5 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q56UQ5 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q56UQ5 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q56UQ5 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q56UQ5 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Q56UQ5 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Q56UQ5 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Q56UQ5 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q56UQ5 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q56UQ5 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q56UQ5 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q56UQ5 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Q56UQ5 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q56UQ5 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q56UQ5 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q56UQ5 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q56UQ5 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Q56UQ5 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q56UQ5 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q56UQ5 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q56UQ5 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Q56UQ5 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Q56UQ5 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q56UQ5 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q56UQ5 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q56UQ5 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q56UQ5 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Q56UQ5 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q56UQ5 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Q56UQ5 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q56UQ5 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q56UQ5 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Q56UQ5 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Q56UQ5 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q56UQ5 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q56UQ5 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q56UQ5 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q56UQ5 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q56UQ5 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q56UQ5 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q56UQ5 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Q56UQ5 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Q56UQ5 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q56UQ5 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q56UQ5 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q56UQ5 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q56UQ5 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q56UQ5 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q56UQ5 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q56UQ5 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q56UQ5 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q56UQ5 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q56UQ5 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q56UQ5 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q56UQ5 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Q56UQ5 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Q56UQ5 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q56UQ5 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q56UQ5 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q56UQ5 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q56UQ5 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q56UQ5 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q56UQ5 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms