Protein–RNA interactions for Protein: Q53GD3

SLC44A4, Choline transporter-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC44A4Q53GD3 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC44A4Q53GD3 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC44A4Q53GD3 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC44A4Q53GD3 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC44A4Q53GD3 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC44A4Q53GD3 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC44A4Q53GD3 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC44A4Q53GD3 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC44A4Q53GD3 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC44A4Q53GD3 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC44A4Q53GD3 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC44A4Q53GD3 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC44A4Q53GD3 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC44A4Q53GD3 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC44A4Q53GD3 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC44A4Q53GD3 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC44A4Q53GD3 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC44A4Q53GD3 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC44A4Q53GD3 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC44A4Q53GD3 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC44A4Q53GD3 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SLC44A4Q53GD3 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SLC44A4Q53GD3 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC44A4Q53GD3 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC44A4Q53GD3 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC44A4Q53GD3 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC44A4Q53GD3 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC44A4Q53GD3 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC44A4Q53GD3 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC44A4Q53GD3 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC44A4Q53GD3 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC44A4Q53GD3 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC44A4Q53GD3 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC44A4Q53GD3 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC44A4Q53GD3 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC44A4Q53GD3 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC44A4Q53GD3 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC44A4Q53GD3 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC44A4Q53GD3 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC44A4Q53GD3 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC44A4Q53GD3 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC44A4Q53GD3 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC44A4Q53GD3 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC44A4Q53GD3 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC44A4Q53GD3 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC44A4Q53GD3 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC44A4Q53GD3 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC44A4Q53GD3 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC44A4Q53GD3 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC44A4Q53GD3 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC44A4Q53GD3 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC44A4Q53GD3 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC44A4Q53GD3 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC44A4Q53GD3 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC44A4Q53GD3 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC44A4Q53GD3 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC44A4Q53GD3 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC44A4Q53GD3 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC44A4Q53GD3 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC44A4Q53GD3 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC44A4Q53GD3 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC44A4Q53GD3 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC44A4Q53GD3 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC44A4Q53GD3 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC44A4Q53GD3 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC44A4Q53GD3 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC44A4Q53GD3 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC44A4Q53GD3 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC44A4Q53GD3 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC44A4Q53GD3 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC44A4Q53GD3 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC44A4Q53GD3 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC44A4Q53GD3 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC44A4Q53GD3 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC44A4Q53GD3 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC44A4Q53GD3 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC44A4Q53GD3 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC44A4Q53GD3 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC44A4Q53GD3 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC44A4Q53GD3 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC44A4Q53GD3 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC44A4Q53GD3 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC44A4Q53GD3 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
SLC44A4Q53GD3 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLC44A4Q53GD3 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLC44A4Q53GD3 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLC44A4Q53GD3 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLC44A4Q53GD3 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC44A4Q53GD3 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC44A4Q53GD3 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC44A4Q53GD3 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC44A4Q53GD3 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC44A4Q53GD3 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC44A4Q53GD3 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC44A4Q53GD3 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC44A4Q53GD3 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC44A4Q53GD3 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC44A4Q53GD3 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC44A4Q53GD3 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC44A4Q53GD3 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms