Protein–RNA interactions for Protein: Q52LD8

RFTN2, Raftlin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN2Q52LD8 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RFTN2Q52LD8 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RFTN2Q52LD8 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RFTN2Q52LD8 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RFTN2Q52LD8 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RFTN2Q52LD8 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RFTN2Q52LD8 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RFTN2Q52LD8 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RFTN2Q52LD8 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RFTN2Q52LD8 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RFTN2Q52LD8 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RFTN2Q52LD8 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RFTN2Q52LD8 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RFTN2Q52LD8 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RFTN2Q52LD8 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RFTN2Q52LD8 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RFTN2Q52LD8 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RFTN2Q52LD8 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RFTN2Q52LD8 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RFTN2Q52LD8 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RFTN2Q52LD8 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RFTN2Q52LD8 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RFTN2Q52LD8 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RFTN2Q52LD8 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RFTN2Q52LD8 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
RFTN2Q52LD8 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RFTN2Q52LD8 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RFTN2Q52LD8 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RFTN2Q52LD8 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RFTN2Q52LD8 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RFTN2Q52LD8 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RFTN2Q52LD8 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RFTN2Q52LD8 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RFTN2Q52LD8 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RFTN2Q52LD8 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RFTN2Q52LD8 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RFTN2Q52LD8 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RFTN2Q52LD8 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RFTN2Q52LD8 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RFTN2Q52LD8 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RFTN2Q52LD8 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RFTN2Q52LD8 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RFTN2Q52LD8 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RFTN2Q52LD8 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
RFTN2Q52LD8 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
RFTN2Q52LD8 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RFTN2Q52LD8 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RFTN2Q52LD8 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RFTN2Q52LD8 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RFTN2Q52LD8 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RFTN2Q52LD8 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RFTN2Q52LD8 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RFTN2Q52LD8 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
RFTN2Q52LD8 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RFTN2Q52LD8 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RFTN2Q52LD8 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RFTN2Q52LD8 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RFTN2Q52LD8 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RFTN2Q52LD8 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RFTN2Q52LD8 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RFTN2Q52LD8 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
RFTN2Q52LD8 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RFTN2Q52LD8 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RFTN2Q52LD8 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
RFTN2Q52LD8 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RFTN2Q52LD8 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
RFTN2Q52LD8 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RFTN2Q52LD8 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RFTN2Q52LD8 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RFTN2Q52LD8 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RFTN2Q52LD8 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RFTN2Q52LD8 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RFTN2Q52LD8 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RFTN2Q52LD8 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RFTN2Q52LD8 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RFTN2Q52LD8 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RFTN2Q52LD8 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RFTN2Q52LD8 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RFTN2Q52LD8 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RFTN2Q52LD8 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RFTN2Q52LD8 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RFTN2Q52LD8 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RFTN2Q52LD8 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RFTN2Q52LD8 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RFTN2Q52LD8 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RFTN2Q52LD8 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RFTN2Q52LD8 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RFTN2Q52LD8 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RFTN2Q52LD8 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RFTN2Q52LD8 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
RFTN2Q52LD8 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RFTN2Q52LD8 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RFTN2Q52LD8 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
RFTN2Q52LD8 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RFTN2Q52LD8 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RFTN2Q52LD8 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RFTN2Q52LD8 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RFTN2Q52LD8 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
RFTN2Q52LD8 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RFTN2Q52LD8 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms