Protein–RNA interactions for Protein: Q49AR2

C5orf22, UPF0489 protein C5orf22, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf22Q49AR2 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
C5orf22Q49AR2 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
C5orf22Q49AR2 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
C5orf22Q49AR2 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
C5orf22Q49AR2 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
C5orf22Q49AR2 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
C5orf22Q49AR2 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
C5orf22Q49AR2 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
C5orf22Q49AR2 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
C5orf22Q49AR2 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
C5orf22Q49AR2 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
C5orf22Q49AR2 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
C5orf22Q49AR2 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
C5orf22Q49AR2 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
C5orf22Q49AR2 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
C5orf22Q49AR2 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
C5orf22Q49AR2 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
C5orf22Q49AR2 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
C5orf22Q49AR2 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
C5orf22Q49AR2 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
C5orf22Q49AR2 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
C5orf22Q49AR2 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
C5orf22Q49AR2 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
C5orf22Q49AR2 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
C5orf22Q49AR2 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
C5orf22Q49AR2 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
C5orf22Q49AR2 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
C5orf22Q49AR2 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
C5orf22Q49AR2 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
C5orf22Q49AR2 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
C5orf22Q49AR2 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
C5orf22Q49AR2 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
C5orf22Q49AR2 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
C5orf22Q49AR2 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
C5orf22Q49AR2 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C5orf22Q49AR2 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
C5orf22Q49AR2 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
C5orf22Q49AR2 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
C5orf22Q49AR2 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C5orf22Q49AR2 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
C5orf22Q49AR2 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
C5orf22Q49AR2 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
C5orf22Q49AR2 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
C5orf22Q49AR2 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
C5orf22Q49AR2 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C5orf22Q49AR2 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
C5orf22Q49AR2 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
C5orf22Q49AR2 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C5orf22Q49AR2 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C5orf22Q49AR2 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
C5orf22Q49AR2 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
C5orf22Q49AR2 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
C5orf22Q49AR2 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
C5orf22Q49AR2 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
C5orf22Q49AR2 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
C5orf22Q49AR2 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
C5orf22Q49AR2 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
C5orf22Q49AR2 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
C5orf22Q49AR2 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
C5orf22Q49AR2 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
C5orf22Q49AR2 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C5orf22Q49AR2 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
C5orf22Q49AR2 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
C5orf22Q49AR2 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C5orf22Q49AR2 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C5orf22Q49AR2 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
C5orf22Q49AR2 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C5orf22Q49AR2 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
C5orf22Q49AR2 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
C5orf22Q49AR2 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
C5orf22Q49AR2 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
C5orf22Q49AR2 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C5orf22Q49AR2 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C5orf22Q49AR2 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C5orf22Q49AR2 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
C5orf22Q49AR2 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
C5orf22Q49AR2 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
C5orf22Q49AR2 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
C5orf22Q49AR2 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
C5orf22Q49AR2 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
C5orf22Q49AR2 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
C5orf22Q49AR2 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
C5orf22Q49AR2 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
C5orf22Q49AR2 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
C5orf22Q49AR2 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
C5orf22Q49AR2 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C5orf22Q49AR2 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C5orf22Q49AR2 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
C5orf22Q49AR2 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C5orf22Q49AR2 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
C5orf22Q49AR2 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C5orf22Q49AR2 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
C5orf22Q49AR2 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
C5orf22Q49AR2 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
C5orf22Q49AR2 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
C5orf22Q49AR2 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
C5orf22Q49AR2 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C5orf22Q49AR2 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
C5orf22Q49AR2 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C5orf22Q49AR2 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms