Protein–RNA interactions for Protein: Q49A92

C8orf34, Uncharacterized protein C8orf34, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf34Q49A92 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
C8orf34Q49A92 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
C8orf34Q49A92 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
C8orf34Q49A92 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
C8orf34Q49A92 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
C8orf34Q49A92 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
C8orf34Q49A92 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
C8orf34Q49A92 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
C8orf34Q49A92 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
C8orf34Q49A92 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
C8orf34Q49A92 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
C8orf34Q49A92 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
C8orf34Q49A92 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
C8orf34Q49A92 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
C8orf34Q49A92 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
C8orf34Q49A92 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
C8orf34Q49A92 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
C8orf34Q49A92 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
C8orf34Q49A92 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
C8orf34Q49A92 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
C8orf34Q49A92 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
C8orf34Q49A92 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
C8orf34Q49A92 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
C8orf34Q49A92 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
C8orf34Q49A92 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
C8orf34Q49A92 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
C8orf34Q49A92 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
C8orf34Q49A92 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
C8orf34Q49A92 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
C8orf34Q49A92 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
C8orf34Q49A92 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
C8orf34Q49A92 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
C8orf34Q49A92 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
C8orf34Q49A92 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
C8orf34Q49A92 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
C8orf34Q49A92 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
C8orf34Q49A92 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
C8orf34Q49A92 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
C8orf34Q49A92 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
C8orf34Q49A92 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
C8orf34Q49A92 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
C8orf34Q49A92 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
C8orf34Q49A92 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
C8orf34Q49A92 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
C8orf34Q49A92 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
C8orf34Q49A92 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
C8orf34Q49A92 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
C8orf34Q49A92 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
C8orf34Q49A92 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
C8orf34Q49A92 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
C8orf34Q49A92 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
C8orf34Q49A92 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
C8orf34Q49A92 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
C8orf34Q49A92 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
C8orf34Q49A92 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
C8orf34Q49A92 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
C8orf34Q49A92 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
C8orf34Q49A92 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
C8orf34Q49A92 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
C8orf34Q49A92 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
C8orf34Q49A92 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
C8orf34Q49A92 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
C8orf34Q49A92 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
C8orf34Q49A92 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
C8orf34Q49A92 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
C8orf34Q49A92 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
C8orf34Q49A92 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
C8orf34Q49A92 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
C8orf34Q49A92 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
C8orf34Q49A92 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
C8orf34Q49A92 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
C8orf34Q49A92 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
C8orf34Q49A92 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
C8orf34Q49A92 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
C8orf34Q49A92 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
C8orf34Q49A92 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
C8orf34Q49A92 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
C8orf34Q49A92 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
C8orf34Q49A92 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
C8orf34Q49A92 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
C8orf34Q49A92 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
C8orf34Q49A92 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
C8orf34Q49A92 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
C8orf34Q49A92 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
C8orf34Q49A92 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
C8orf34Q49A92 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
C8orf34Q49A92 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
C8orf34Q49A92 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
C8orf34Q49A92 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
C8orf34Q49A92 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
C8orf34Q49A92 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
C8orf34Q49A92 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
C8orf34Q49A92 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
C8orf34Q49A92 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
C8orf34Q49A92 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
C8orf34Q49A92 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
C8orf34Q49A92 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
C8orf34Q49A92 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
C8orf34Q49A92 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
C8orf34Q49A92 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms