Protein–RNA interactions for Protein: Q499Z3

SLFNL1, Schlafen-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFNL1Q499Z3 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SLFNL1Q499Z3 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SLFNL1Q499Z3 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SLFNL1Q499Z3 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SLFNL1Q499Z3 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SLFNL1Q499Z3 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SLFNL1Q499Z3 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SLFNL1Q499Z3 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SLFNL1Q499Z3 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SLFNL1Q499Z3 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SLFNL1Q499Z3 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SLFNL1Q499Z3 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SLFNL1Q499Z3 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SLFNL1Q499Z3 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SLFNL1Q499Z3 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SLFNL1Q499Z3 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SLFNL1Q499Z3 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
SLFNL1Q499Z3 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
SLFNL1Q499Z3 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
SLFNL1Q499Z3 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SLFNL1Q499Z3 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SLFNL1Q499Z3 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SLFNL1Q499Z3 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SLFNL1Q499Z3 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SLFNL1Q499Z3 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SLFNL1Q499Z3 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SLFNL1Q499Z3 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SLFNL1Q499Z3 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SLFNL1Q499Z3 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SLFNL1Q499Z3 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SLFNL1Q499Z3 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
SLFNL1Q499Z3 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
SLFNL1Q499Z3 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
SLFNL1Q499Z3 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
SLFNL1Q499Z3 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SLFNL1Q499Z3 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SLFNL1Q499Z3 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SLFNL1Q499Z3 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SLFNL1Q499Z3 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SLFNL1Q499Z3 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SLFNL1Q499Z3 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SLFNL1Q499Z3 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SLFNL1Q499Z3 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SLFNL1Q499Z3 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SLFNL1Q499Z3 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SLFNL1Q499Z3 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
SLFNL1Q499Z3 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SLFNL1Q499Z3 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SLFNL1Q499Z3 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SLFNL1Q499Z3 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SLFNL1Q499Z3 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SLFNL1Q499Z3 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SLFNL1Q499Z3 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SLFNL1Q499Z3 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLFNL1Q499Z3 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLFNL1Q499Z3 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLFNL1Q499Z3 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLFNL1Q499Z3 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLFNL1Q499Z3 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
SLFNL1Q499Z3 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLFNL1Q499Z3 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SLFNL1Q499Z3 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SLFNL1Q499Z3 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SLFNL1Q499Z3 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SLFNL1Q499Z3 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SLFNL1Q499Z3 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SLFNL1Q499Z3 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SLFNL1Q499Z3 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SLFNL1Q499Z3 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SLFNL1Q499Z3 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SLFNL1Q499Z3 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SLFNL1Q499Z3 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SLFNL1Q499Z3 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SLFNL1Q499Z3 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SLFNL1Q499Z3 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SLFNL1Q499Z3 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SLFNL1Q499Z3 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SLFNL1Q499Z3 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC27.57■■■□□ 2
SLFNL1Q499Z3 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SLFNL1Q499Z3 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SLFNL1Q499Z3 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SLFNL1Q499Z3 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
SLFNL1Q499Z3 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SLFNL1Q499Z3 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SLFNL1Q499Z3 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SLFNL1Q499Z3 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
SLFNL1Q499Z3 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
SLFNL1Q499Z3 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SLFNL1Q499Z3 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
SLFNL1Q499Z3 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SLFNL1Q499Z3 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SLFNL1Q499Z3 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SLFNL1Q499Z3 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SLFNL1Q499Z3 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SLFNL1Q499Z3 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SLFNL1Q499Z3 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
SLFNL1Q499Z3 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
SLFNL1Q499Z3 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC27.55■■■□□ 2
SLFNL1Q499Z3 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
SLFNL1Q499Z3 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms