Protein–RNA interactions for Protein: Q495C1

RNF212, Probable E3 SUMO-protein ligase RNF212, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF212Q495C1 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RNF212Q495C1 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RNF212Q495C1 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RNF212Q495C1 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
RNF212Q495C1 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
RNF212Q495C1 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
RNF212Q495C1 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
RNF212Q495C1 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
RNF212Q495C1 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RNF212Q495C1 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
RNF212Q495C1 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
RNF212Q495C1 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
RNF212Q495C1 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RNF212Q495C1 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RNF212Q495C1 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RNF212Q495C1 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RNF212Q495C1 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RNF212Q495C1 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RNF212Q495C1 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RNF212Q495C1 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RNF212Q495C1 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RNF212Q495C1 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RNF212Q495C1 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RNF212Q495C1 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RNF212Q495C1 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RNF212Q495C1 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RNF212Q495C1 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RNF212Q495C1 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RNF212Q495C1 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RNF212Q495C1 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RNF212Q495C1 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RNF212Q495C1 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RNF212Q495C1 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
RNF212Q495C1 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
RNF212Q495C1 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RNF212Q495C1 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RNF212Q495C1 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RNF212Q495C1 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RNF212Q495C1 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RNF212Q495C1 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RNF212Q495C1 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RNF212Q495C1 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RNF212Q495C1 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RNF212Q495C1 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
RNF212Q495C1 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RNF212Q495C1 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RNF212Q495C1 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RNF212Q495C1 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RNF212Q495C1 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RNF212Q495C1 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RNF212Q495C1 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RNF212Q495C1 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RNF212Q495C1 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RNF212Q495C1 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RNF212Q495C1 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RNF212Q495C1 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RNF212Q495C1 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RNF212Q495C1 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RNF212Q495C1 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RNF212Q495C1 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RNF212Q495C1 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RNF212Q495C1 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RNF212Q495C1 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RNF212Q495C1 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RNF212Q495C1 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RNF212Q495C1 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RNF212Q495C1 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RNF212Q495C1 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RNF212Q495C1 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RNF212Q495C1 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RNF212Q495C1 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RNF212Q495C1 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RNF212Q495C1 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RNF212Q495C1 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RNF212Q495C1 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RNF212Q495C1 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
RNF212Q495C1 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RNF212Q495C1 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RNF212Q495C1 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RNF212Q495C1 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RNF212Q495C1 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RNF212Q495C1 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RNF212Q495C1 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RNF212Q495C1 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RNF212Q495C1 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RNF212Q495C1 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RNF212Q495C1 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RNF212Q495C1 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RNF212Q495C1 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RNF212Q495C1 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RNF212Q495C1 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RNF212Q495C1 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RNF212Q495C1 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RNF212Q495C1 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RNF212Q495C1 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RNF212Q495C1 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RNF212Q495C1 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RNF212Q495C1 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RNF212Q495C1 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RNF212Q495C1 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10 ms